南疆地区是中国最西的门户，是直达中亚、西亚、南亚的桥头堡，与巴基斯坦、阿富汗、印度、吉尔吉斯斯坦、塔吉克斯坦等国接壤,由于地理、历史、民族、文化、宗教等因素，南疆地区部分少数民族民众抑或干部受到等外来思想、意识、文化的影响，其价值、行为、道德、心灵、信念、意志、情感、人生观、世界观等多方面深受波动，致使南疆地区主流意识形态受到冲撞、激荡、挑战。本文运用文献综述和实地调查的方法，分析其所致原因，找到应对策略，有利于南疆地区主流意识形态充分发挥其整合功能，破除一切不利南疆地区发展的因素，使南疆地区在对口援建中又好又快发展，更加为新疆的跨越式发展和长治久安打下坚实的政治基础。本文共分四个部分：一、引言介绍本论文的选题背景、意义、研究综述、方法、创新处和不足点。二、主流意识形态禀赋这一章从两个方面理解：首先是主流意识形态内涵、价值及特征。其次，主流意识形态的整合功能，即统摄功能、导向功能、维护功能、教育功能，为南疆地区主流意识形态对其整合功能提供理论基础。三、南疆地区主流意识形态整合面临的挑战（一）南疆地区多元文化激荡。（二）西方反华势力对新疆民族与宗教势力的支持。（三）南疆地区主流意识形态工作存在的问题。从南疆地区主流意识形态整合功能面临的各种挑战进行分析，寻找应对策略，使南疆地区主流意识形态对南疆地区各种意识进行整合，促进南疆地区发展。四、增强南疆地区主流意识形态整合功能对策本章是全文的核心部分，在分析南疆地区的特殊性及意识形态面临的挑战的基础上，有针对性地提出加强南疆地区主流意识形态的整合对策：（一）增强主流意识形态吸引力、感染力、凝聚力。第一,创新主流意识形态话语。第二,主流意识形态吸取少数民族文化精华。第三,弱化南疆地区社会宗教氛围。（二）深入持久开展意识形态领域反分裂斗争再教育。第一,加强“四个认同”教育。第二,加强法制教育。（三）加强南疆地区族际交流。第一,加强南疆地区各族互学语言。第二,增强南疆地区多元文化之间交流交融。第三,密切南疆地区族际成员日常交流交往。第四,加强南疆地区族际经济交流。