科学哲学对西方经济学方法论产生了重大的影响。在卡尔·波普尔(Karl Popper)证伪主义科学哲学之前,影响西方经济学方法论的主要是科学哲学中的逻辑实证主义。由于逻辑实证主义过分强调经验证实在区分科学与非科学之间的作用,对科学的定义过于严格,片面推崇归纳法,反对演绎法等等理论上的缺陷以及实践上的困难导致了经济学“科学”梦想的幻灭。波普尔的证伪主义反对经验归纳主义,推崇理性演绎主义,用否证论代替实证论,从对理论的外在辩护转向内在批判。这种方法实现了经济学思维方式的变革。证伪主义是波普尔在经济学中的遗产。波普尔证伪主义被哈奇森引入经济学之后,针对证伪主义方法论中证伪的是该是理论的前提还是预测的问题,经济学家弗里德曼与萨缪尔森展开了经济学方法论的操作主义和工具主义的大争论。在争论的风波还未平息之时,经济学家又开始对证伪主义方法论进行一定程度的批判,并实现了某种突破,由此证伪主义向历史主义转变。波普尔证伪主义方法论具有合理性和进步意义。它提供了一套比证实主义更加容易实施的方法论原则;它强调“不断证伪”和“逼真度”,这与马克思的方法论有一致之处;经济学中存在证伪的例子,凸显了证伪主义的实用意义;猜想和反驳的方法对我国的经济学发展也具有重要的现实意义。但是,证伪主义本身也存在理论缺陷。“杜恒—奎因命题”说明了经验检验理论的失败,经验本身无法提供可靠的知识基础,证伪主义的真理观存在缺陷,经济学的证伪本身就并非易事。最后,站在马克思主义的立场上,对经济学方法论进行哲学反思,指出无论是证实主义还是证伪主义方法论都不是经济学的科学之路。经济学方法的出路应该是归纳和演绎,证实和证伪,逻辑与历史,实证与规范的辩证统一。