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淀粉是小麦籽粒的主要组分,决定小麦加工品质的优劣。本研究以黄淮南片地区150份小麦品种(系)作为试验材料,在两年5个环境条件下对其淀粉相关性状表现进行了鉴定,并利用小麦35K SNP芯片检测结果对其进行了全基因组关联分析。主要研究结论如下:1.采用35K SNP芯片对150份小麦品种(系)进行全基因组扫描,得到35143个SNP标记检测结果,筛选后获得9552个多态性高、稳定存在的优质标记。通过群体结构与主成分分析,参试材料被划分成两个亚群。多态性信息含量(PIC)范围为0.0950-0.5000,在3个染色体组A、B和D中的分布为A(0.3317)>B(0.3240)>D(0.3100)。连锁不平衡分析发现A、B、D和全基因组的LD衰减距离分别为4.7、8、11和6 Mb。2.总淀粉含量与支链淀粉含量呈极显著正相关,与硬度指数、蛋白质含量和湿面筋含量呈极显著负相关。直链淀粉含量与支链淀粉含量、硬度指数和蛋白质含量呈极显著负相关,与湿面筋含量呈显著负相关。支链淀粉含量与蛋白质含量和湿面筋含量呈极显著负相关。蛋白质含量与湿面筋含量呈极显著正相关,其相关系数高达0.981。3.小麦淀粉性状共检测到545个相关标记,其中总淀粉含量标记197个,直链淀粉含量标记214个,支链淀粉含量标记134个。在2个或2个以上环境中检测到稳定表达的SNP共9个。与总淀粉含量相关的稳定标记3个,它们分别位于3D、6B和7B上,表型变异贡献率R2范围6.:30%-12.00%。与直链淀粉含量相关的稳定标记6个,它们分别位于5B、5D、6A、6B、6B和6D上,其中位于5B上的AX-95258242在3个环境中检测到,表型变异贡献率R2范围5.10%-9.00%。支链淀粉含量只能在单一环境中检测到相关位点。淀粉含量相关位点AX-92441403-A具有最大效应值,能增加淀粉含量1.72%,AX-95100615-C增加淀粉含量1.40%,AX-94494277-A降低淀粉含量1.51%,它们在参试材料中占有频率分别为90.60%、11.03%和87.60%。直链淀粉含量的AX-94391044-A、AX-951 59175-A、AX-95209203-A、AX-94 781187-A、X-94685800-A和AX-95258242-A均为降低其含量,在参试材料中占有频率分别为 91.78%、89.19%、89.19%、85.45%、69.13%和 69.59%。4.小麦蛋白质含量、湿面筋含量和硬度指数性状共检测到675个相关标记,其中蛋白质含量标记163个,湿面筋含量标记228个,硬度指数标记284个。在2个或2个以上环境中稳定表达的SNP标记共147个。与蛋白质含量相关的稳定标记42个,它们分别位于15条染色体上,表型变异贡献率R2范围5.63%-17.18%,其中位于5B上的AX-94843838在4个环境中检测到。与湿面筋含量有关的稳定标记36个,分别位于13条染色体上,表型变异贡献率R2范围5.64%-14.61%,其中位于1D上的AX-94780647在4个环境中检测到。与硬度相关的稳定标记69个,分别位于16条染色体上,表型变异贡献率R2范围5.57%-34.09%,其中AX-94813152、AX-94795975、AX-95631542、AX-94922331、AX-94991433 和 AX-94716438在5个环境中均检测到。3个品质性状共发现147个优势等位变异。位于6B上的AX-94414203-A降低蛋白质含量1.61%,对蛋白质含量降低具有最大效应值,位于5A上的AX-94690816-A增加蛋白质含量1.10%,是增加蛋白质含量的最大效应位点,在参试群体材料中分别占90.60%和6.00%。位于1D上的AX-94780647-A和6B上的AX-94414203-A降低湿面筋含量超过3%,分别是3.36%和3.66%,位于5A上的AX-9469081 6-A增加湿面筋含量2.46%,在参试群体材料中分别占93.33%、90.60%和5.98%。位于5A上AX-95112961-A增加硬度指数21.34,是最大效应值,位于5D上的AX-23627-G降低硬度指数19.33,在参试群体材料中分别占94.56%和5.17%。5.共发现115个候选基因。其中15个候选基因是2个或者2个以上性状的候选基因,TraesCS6B02G136400是淀粉含量、蛋白质含量和湿面筋含量共同的候选基因,其余均是蛋白质含量和湿面筋含量的候选基因。除TraesCS4A02G343900和TraesCS5D02G339400外,其余13个候选基因均有基因或蛋白功能注释,有待进一步研究。在2个不同SNP位点具有同一候选基因共6个,位于2A上的AX-94960802和AX-952503 70共有蛋白质含量候选基因TraesCS2A02G080700,位于5D上的AX-795268和AX-94861346共有湿面筋含量候选基因TraesCS5D02G544700,其余4个均为共有硬度指数候选基因,分别为AX-94750591和AX-94957845的候选基因TraesCS1B02G240400,AX-95000586和AX-9513 7260的候选基因TraesCS1D02G226200,AX-94637067和AX-94749848的候选基因TraesCS2D02G391000以及AX-94417031和AX-95629800的候选基因TraesCS5B02G384200。