随着当今全球经济与知识一体化的进程的日益加深,一方面世界经济发展的格局走向已呈现出显著的区域化特征,经济分工已逐渐不再以国家,而转向以区域为主进行；另一方面,科学技术对于经济增长的推动作用愈发显著,创新驱动也已成为世界各国谋求未来发展的共识。在此种背景交融下,区域科技创新能力的高低便不言而喻成为能否支撑地区经济增长进而带动国家腾飞,最终赢得全球竞争中核心优势的决定性因素。中国正处于社会经济转轨的特殊阶段,国内各个省区之间无论是自然禀赋条件还是经济发展水平等各方面均存在较大差距,如何实现这一阶段内以技术进步为核心内涵的全域经济稳健与持续增长,是一项极具挑战的任务。《国家中长期科技发展规划纲要(2006-2020年)》中明确提出,要将区域创新体系作为建设创新型国家战略的重要组成部分,及经济增长与社会进步的核心推动力,从而为区域创新活动的发展提供了具体指向。基于以上,本文旨在从以下几方面对我国区域创新进行研究,以期对区域创新活动的效能提升及治理模式的建构有所裨益,并为相关部门的政策出台提供参考和依据。(1)回顾和梳理了关于创新的主要相关理论,并对几种典型区域创新范式模型进行了述评。首先对创新基本理论、技术创新理论、国家创新理论以及区域创新理论的内涵及外延均进行了较为详细与系统的介绍。之后选取了区域创新研究发展阶段中四个不同时期里较具代表性的区域创新范式模型分别进行了描述与评价。在对区域创新系统模式研究的发展历程有所概观的基础上,指出了将纵向不同层级的各个主体行动者与横向不同区域创新活动环节之间实现有效地结合,是建构良好的区域创新网络,并促进其运行效能提升的关键之处。(2)利用共词网络分析了我国区域创新近二十年来的研究现状,总结当前研究热点并对未来研究趋势进行预判。将文献计量学方法与社会网络分可视化图谱工具相结合,以1990-2012年间我国区域创新研究文献的关键词条目为节点建构共词网络,直观地呈现出该领域的发展概貌。基于此,总结提炼得到当下学界在区域创新研究领域的八大聚焦热点；并预判围绕以企业为技术创新中心主体这一基点对区域创新发展问题予以研究,将是未来若干年间我国该领域研究的主要着眼点。(3)采用数据统计结果比对与基尼系数分解方法,分别对我国与创新发达国家之间的R&D要素投入差距、以及我国内部区域之间的R&D资源配置差距进行研究。通过将我国R&D资本与人力的投入现状与等创新发达国家比对发现,我国R&D资源投入方面存在强度与水平偏低,以及追求短期效应等问题。之后采用基尼系数分解方法对我国区域内部R&D资源配置差距情况研究,结果显示2004年以来,我国无论是R&D经费支出还是人员配置上,东、中、西三大区域以及区域之间的差距水平总体上变动缓慢且无明显改善趋势,而东、中、西三大区域间的R&D资源配置的不均衡则是导致总体差距显著的主要原因。(4)对我国区域创新活动的经济增效、分阶段与整体运行效率以及可能影响因素进行了详细的测度与评价。首先,采用主成分萃取与建构评价模型相结合的方法,对我国R&D投入与产出的综合增效以及在其影响下的区域经济发展增效进行测算与评价；之后采用网络数据包络分析(Net-DEA)方法对我国区域创新科技成果产出、科技成果转化及整体效率分别予以测算和评价,并对结果作聚类分组讨论；最后采用随机前沿分析(SFA)方法,估计了我国R&D资本与人力两大生产要素及各项非技术效率因素对于区域创新活动的影响作用,结果显示,我国区域创新活动的外部环境仍有较大待改善与提升空间。(5)基于共生理论,对以技术转移活动为依托的我国跨区域合作创新网络进行测评与治理研究。首先引入共生理论对跨区域技术转移合作创新网络作概念界定,之后对基于跨区域技术转移的合作创新活动其共生能量生成和吸收消化水平进行实证测度和分析。从而建构基于我国30个省区的具备完整时空维度的跨区域技术转移合作创新网络。结合上述分析结果,从微观主体合作层面及宏观区域协同层面两个角度上,对我国跨区域技术转移合作创新网络提出相应的共生治理方案和倡议。