基于二代测序技术的遗传性痉挛性截瘫一家系突变情况的研究

来源 :南昌大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:neu20063043
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目的:对遗传性痉挛性截瘫伴薄型胼胝体(Hereditary spastic paraplegia with a thin corpus callosum,HSP-TCC)一家系进行二代测序,从而明确本家系的致病基因。方法:对本家系患者进行临床诊断,总结患者临床-遗传特点,构建标准家系图,选取4名家系成员(患者及同辈兄妹共4人)作为待测样本。1.临床诊断:病史采集、神经系统体格检查、实验室检查、颅脑MRI等;2.基因检测:取上述待测样本外周血,提取DNA。应用HSP相关致病基因全外显子测序、全外显子组测序结合Sanger测序等方法,检测本家系的基因突变情况。结果:一患者样本通过HSP相关致病基因全外显子测序,并未发现已知的HSP致病基因,但排除绝大部分临床上主诉为痉挛性截瘫的其他遗传病;随后进行另外3个样本的全外显子组测序结合Sanger测序,发现大量新发SNPs和Indels,并筛选出可能有意义的候选基因NBPF1和AHI1突变。结论:在具有典型HSP-TCC临床表现的家系患者中,其致病基因并非目前已知的HSP致病基因,而是一种新发的罕见突变,可能是目前未成功克隆的HSP亚型致病基因亦或一新发HSP亚型;通过基因芯片测序,发现大量新发SNPs和Indels,并筛选出该家系可能有意义的候选致病基因:NBPF1和AHI1基因;建立了对HSP的基因检测流程,可用于HSP患者的早期筛查和基因诊断,为产前诊断提供可靠依据;Sanger测序、自定义Gene Panel全外显子测序和全外显子组测序各有优缺点,正确选择基因检测的方法、保证测序过程的严谨和信息分析方法的完备,是确保研究结果的准确可靠的必要条件。
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