油菜是我国主要的油料作物，也是食用油的主要来源，随着近年来油菜参试品种越来越多，且监管体系不够完善，市面上有较多的套牌甚至冒牌的品种出现，导致农民大幅减产甚至绝产，严重损害了育种工作者、经营者和生产者的利益，科学家们越来越意识到为品种建立特异的身份信息的重要性。SSR分子标记因其稳定性高、多态性丰富，且是共显性标记，被广泛的用于品种的鉴定和指纹图谱的构建中。本研究利用SSR分子标记，对87份材料进行指纹分析。　　种子纯度是育种者和使用者非常关心的问题，生产的杂交种必须达到一定的纯度要求才能进入市场供给农民生产种植，分子标记检测种子纯度的方法，因其自身条件的制约，已逐渐不能满足现在高通量的需求。q-PCR技术以灵敏、高效、准确、高通量的特点，广泛应用于生物学领域，本研究采用q-PCR技术，构建了一种新的种子纯度鉴定模型，能快速的检测杂交种的纯度。主要结果如下:　　1、从57个SSR标记中筛选到了36个标记，对87份（包括2份保持系材料，15份不育系材料，64份萝卜质雄性不育恢复系材料，还有6份常规种选系）甘蓝型油菜进行指纹分析，共扩增出111条多态性带，平均每个标记3.08条，标记的平均PIC值为0.47，利用这些标记进行UPGMA聚类分析，将87份材料分为7类，分别为A-G，其中A类类群最大，共包括54份材料，又可以分为两个亚类，第一亚类主要包括12份不育系，而第二亚类主要包括29份恢复系。　　2、挑选了15个多态性较高、且可以将材料区分开的核心标记，构建了64份萝卜质雄性不育恢复系的数字身份证和二维码。　　3、将P74-17和华油杂62作为实验材料，配置了已知恢复基因浓度梯度的标准品，利用q-PCR技术构建了甘蓝型油菜萝卜质杂交种纯度的快速检测模型，标准曲线的回归方程为y=-3.3396x+0.3617，相关系数为0.9635，方差分析F值为449.3。统计了田间187份样本的纯度，和用标准曲线计算的样本纯度进行回归分析，两者的线性回归系数为0.8604，方差分析F值为1140.2，两者呈高度相关。