毕氏肠微孢子虫是一种严格的胞内寄生真核生物,可感染人和多种动物,引起免疫缺陷宿主(如艾滋病人)致死性腹泻。目前,已在西班牙、瑞典、巴西、伊朗、埃及和中国多个地区不同的山羊和绵羊品种中发现了毕氏肠微孢子虫的感染。基于毕氏肠微孢子虫核糖体RNA内转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)序列分析发现,山羊和绵羊体内至少存在90种不同的基因型,其中人兽共患基因型至少30种,提示这些羊只可能具有将毕氏肠微孢子虫传播给人的风险。乌骨山羊和乌骨绵羊是起源于云南省兰坪县的重要地方羊品种,具有丰富的营养价值及药用价值。但是,目前尚缺乏关于毕氏肠微孢子虫在乌骨山羊和乌骨绵羊中感染情况的研究。基于此,本研究从云南省石林、永胜、兰坪、美水以及杉树采集了325份乌骨绵羊粪便样品以及336份乌骨山羊粪便样品,应用基于ITS的分子生物学方法对这些样品中毕氏肠微孢子虫的感染率及基因型进行了研究,并采用基于微卫星及小卫星的多位点序列分型技术(Multi-locus sequence typing tool,MLST)对所获得的分离株进行了遗传多样性分析。1.乌骨羊毕氏肠微孢子虫的总感染率为10.59%(70/661),乌骨绵羊(12.31%,40/325)的感染率略高于乌骨山羊(8.93%,30/336),但统计学差异不显著(χ~2=1.781,P>0.05);所调查的5个地区乌骨羊均存在毕氏肠微孢子虫的感染,且感染率差异显著(χ~2=9.629,P<0.05),其中兰坪县乌骨羊的感染率最高(14.79%,21/142),其次为美水(14.75%,9/61)、石林(12.24%,24/196)和杉树(7.75%,11/142),感染率最低的是永胜(4.17%,5/140);所调查的4个年龄段的乌骨羊均存在毕氏肠微孢子虫感染,且感染率差异显著(χ~2=18.59,P<0.001),毕氏肠微孢子虫感染率随着乌骨羊年龄的增长呈现下降趋势。2.序列分析发现,本研究乌骨羊感染的毕氏肠微孢子虫存在12种基因型,包括已知的10种基因型(BEB6、COSⅠ、SX1、CM21、CHG3、CHG1、CHS5、EbpC、COSⅡ和PigEb4)及2种新基因型(YNS1和YSM1),基因型BEB6为乌骨绵羊及乌骨山羊的优势基因型;进化分析发现,基因型EbpC、CHS5及PigEb4属于group 1,具有潜在人兽共患风险,其他基因型属于group 2;MLST分析发现,乌骨羊感染的毕氏肠微孢子虫存在12种多位点基因型(multilocus genotypes 15~26,MLG15~MLG26),其中乌骨绵羊中有11种MLG,而乌骨山羊仅有1种MLG。综上所述,云南省乌骨绵羊以及乌骨山羊存在毕氏肠微孢子虫感染,其感染与年龄和地理分布密切相关,并且乌骨绵羊和乌骨山羊的毕氏肠微孢子虫存在遗传多样性和人兽共患风险,这些研究结果为云南省乌骨羊及其它宿主毕氏肠微孢子虫病的防控提供了基础数据。