融资融券交易是证券市场一项普遍和成熟的交易制度，从境外资本市场发展过程看，对完善市场功能起到了诸多积极作用。融资融券业务在我国刚刚推出，仍在试点阶段，所以无论是理论还是实践，仍然有许多亟待研究与解决的问题。该篇论文主要研究融资融券业务中的投资者利益保护，在我国资本市场和证券市场中，中小投资者的投资比例重大，构成了当前中国证券市场的基础，所以对投资者的利益保护关系重大，不仅仅涉及到投资者的投资利益及其投资的积极性，而且涉及到中国证券市场的稳定发展。本文从六个部分对其进行了介绍分析，第一部分简单介绍了融资融券的基本概念和特征；第二部分利用SWOT分析法介绍了融资融券交易中中小投资者利益保护现状及存在的问题；第三部分介绍了融资融券交易中对中小投资者保护的重要意义；第四部分介绍了融资融券交易中中小投资者利益保护过程中遇到的新风险或者面临的新形势；第五部分介绍了对中小投资者利益保护经验做法；第六部分是本论文的重点，即就中小投资者利益保护的措施及对策进行了深入研究和探讨。本文主要通过对国外及中国台湾、香港地区融资融券市场的经验做法进行研究，分析其利弊，结合我国证券市场融资融券业务的具体实际，取其精华，去其糟粕，学习好的制度规范，避免缺陷，创新理论及做法，特别是在中小投资者利益保护方面展开深入探讨，建立更为适合我国证券市场发展的制度规范，从而推动我国融资融业务的发展。