药物滥用给人类健康和生态平衡带来的危害不象其它环境污染那样直观，它的隐形性使得人们一度无视它对健康的严重威胁以及对环境的潜在污染。因此，建立简单快速有效的分析方法对药物进行监控是十分必要的。基于环境样品的复杂性考虑，本文选用毛细管电泳这一高效快速的分离技术进行生化药物的分析。本论文的研究工作包括两方面。一方面为抗生素类药物的毛细管电泳分离分析，另一方面为生物大分子的毛细管电泳在线富集方法的探究。 为此，本文在简介毛细管电泳原理的基础上，论述了分离模式，检测方法，在线富集技术及其在生化药物分析中的研究进展。并讨论了贯穿于本文每个研究章节的重要物质——表面活性剂在毛细管电泳中的应用。内容如下： (1)抗生素类药物的毛细管胶束电动色谱的分离分析。 由抗生素滥用带来的环境问题已不容忽视。因此，建立行之有效的抗生素的分析检测方法迫在眉睫。采用毛细管胶束电动色谱分离模式，通过优化分离条件，可同时实现对阿莫西林，氯唑西林，头孢氨苄，头孢噻肟，头孢唑林五种抗生素的检测。仅需9分钟的分析时间，线性范围0.1-250mg／ml，相关系数为0.9976-0.9994，检测限为0.01-0.13mg／ml。该分析方法简单快速，行之有效。将该方法应用于合成尿样中抗生素的分析，日间和日内的RSDs分别为1.31-6.07％和0.66-7.65％，回收率为90％-110％。该方法同样应用于商品化药物的分析检测，日间和日内的RSDs分别为3.95-8.12％和1.51-2.86％，迁移时间的日间和日内的RSDs分别为0.47-1.11％和0.032-0.295％。此外，本文还对分离条件对抗生素的迁移行为的影响做了理论探讨。