长江作为我国第一大河，其流域面积占全国总面积的五分之一。长江流域渔业资源在数量及结构上均在我国占有重要地位。随着长江流域经济快速发展，长江流域渔业资源正在不断衰减，许多珍稀特有鱼类濒临灭绝，切实保护长江流域渔业资源势在必行。第一部分主要阐述长江流域渔业资源的现状。一方面从长江流域不同时间的鱼类捕捞量变化，及长江流域总体鱼类捕捞量占全国水产捕捞总量比重的变化，清晰的看出长江流域渔业资源数量不断减少。另一方面，从长江流域鱼类结构入手，分析长江流域的珍稀鱼类的数量及种群变化，发现长江流域渔业资源衰减严重。第二部分主要是对长江流域渔业资源衰减的法律问题的分析。过度捕捞直接减少长江流域渔业资源数量，具体体现在长江流域禁渔期制度禁渔规定不科学，渔政执法能力不足等；水利工程的过度建设破坏长江流域鱼类生存环境，而这主要是因为长江流域渔业资源影响评价制度不到位，环境规划制度不合理；长江流域水污染加剧渔业资源衰减，这是因为长江流域环境标准缺乏系统性，缺少长江流域统一水污染防治规划；失控的水产养殖破坏长江流域的鱼类生存环境，究其原因是长江流域水产养殖规划缺失及水产养殖执法不力等。第三部分主要是针对第二部分的法律问题分析，结合长江流域渔业资源的自身特点，提出具体的制度完善建议。具体而言是从完善长江流域禁渔期制度，促进长江流域鱼类数量增加；健全相应环境标准制度，包括水污染总量控制制度、地表水水质标准等，保护长江流域鱼类生存环境；完善长江流域的水产养殖规划、水污染防治规划等，加强长江流域综合规划，建立长江流域渔业资源保护规划制度；通过推动长江流域渔民转产转业，加大人工增殖放流等完善长江流域渔业资源生态补偿制度；完善长江流域水利工程的环评程序及环评范围，并加大对其的监督力度，促进长江流域水利工程环评制度，保护长江流域鱼类生存环境；保护长江流域珍稀鱼类就需要一方面改革鱼类自然保护区的管理体制，拓宽鱼类自然保护区筹资机制，保证长江流域鱼类自然保护区正常运行，进而保护长江流域的珍稀濒危鱼类。