有效保护中小股东权益是理论界和实务界关注的焦点话题。除了美国、英国等少数国家之外，绝大部分国家资本市场的股权构成呈现集中分布状况，出现大股东控制现象。在上市公司的复杂治理结构下，大股东与中小股东因其利益目标差异，将可能导致权益冲突出现。中小股东所持有股份比例较小，在公司运营决策过程中难以产生有效影响；大股东通过对于公司的实际控制，通过干预董事会决策及其他途径实现对公司运营的有效影响。在此情况下，大股东侵害中小股东权益的事件时有发生，大股东非法占用上市公司资金现象、不公平关联交易等行为屡见不鲜。为有效维护中小股东权益、保护资本市场运行效率，各国政府实施了诸多制度与完善措施，其中包括审计机制。作为一项维护市场运行秩序的治理机制，审计机制能够有效缓解市场主体之间的信息不对称，起到监管代理人的作用。在上市公司股东权益冲突的情况下，审计机制通过信号传递发挥监管作用，保障公司治理决策维护所有股东权益，实现大股东监管和中小股东保护。基于上述背景，本文探讨审计机制在资本市场如何保护中小股东权益，并对我国资本市场中审计机制的运行效果进行检验。从研究思路来看，本文首先对相关理论基础进行探讨，从委托代理理论、审计声誉理论、公司治理理论等视角出发，厘清审计保护的理论基础；其次，本文对审计机制的作用机理进行探讨，分析了审计机制保护中小股东权利的具体内容、运行机理与关键环节；再次，本文结合中国上市公司2009-2013年数据，对审计机制作用效果进行实证分析，检验审计机制能够有效识别并传递大股东治理相关信息；最后，本文从审计机制完善、公司治理结构完善、资本市场环境优化等方面出发，提出未来工作的完善措施。