微生物次级代谢产物产物是人类最重要的天然宝库之一,微生物次级代谢产物结构多样如聚酮类天然产物、寡肽类天然产物、萜类、核苷类天然产物等,它们具有广泛的生物活性如抗细菌、抗真菌、抗肿瘤、免疫抑制等,同时还广泛的应用于食品、保健品、化妆品等行业,给人们的生产生活带来了极大的便利。聚酮类天然产物是微生物次级代谢产物中最大的家族,是新型药物开发研究的重要来源。本论文通过对用不同的培养基对大量的链霉菌、真菌的发酵筛选,通过对这些菌株发酵代谢产物的分析,选择了一株真菌NF666和一株放线菌NA6319,对其次级代谢产物进行分离与结构鉴定。本论文首先对昆虫内生真菌NF666的次级代谢产物进行了研究,通过大米培养基发酵,经过萃取、正向硅胶、ODS反相柱、Sephadex LH-20凝胶柱和高效液相（HPLC）等分离得到了化合物1-11,9个为新化合物。通过对高分辨质谱（LC-MS）和核磁共振谱图(~1H NMR,13C NMR,~1H-~1H COSY,DEPT,HSQC,HMBC,NOESY)的解析,最终确定了化合物1-11的平面结构。其中化合物1-7属于聚酮类天然产物,化合物8-11属于嗜铁素类化合物。之后对土壤放线菌NA6319的次级代谢产物进行了研究,通过液体培养基发酵,经萃取、ODS反向柱、凝胶柱、HPLC等分离得到了化合物12-18,4个为新化合物。通过对高分辨质谱（LC-MS）和核磁共振谱图(~1H NMR,13C NMR,~1H-~1H COSY,DEPT,HSQC,HMBC,NOESY)的解析,最终确定了化合物12-18的平面结构,化合物12-18都属于聚酮化合物中的manumycin家族。最后对化合物1-18进行了抗菌活性测试,结果表明聚酮化合物（6）和（7）对Pseudomonas aeruginosa,Staphylococcus aureus,Escherichia coli,Pectobacterium carotovorum subsp.Carotovorum具有良好的抗菌活性。本论文对微生物来源的聚酮化合物的结构和生物活性进行了综述。