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苹果果形与果实大小是苹果外观品质的重要指标之一,本试验以红玉×金冠杂交F1为试材,连续调查2008年和2009年果实纵径、横径和单果重的表型数据,对F1代果实纵径、横径进行遗传分析,并和单果重,果形指数进行相关性分析,随后用SSR和SNP图谱对果实纵径,横径,单果重,果形指数做了QTL分析,对遗传效应大的QTL区段预测了可能的候选基因。果实单果重、果实横径、果实纵径在2008年和2009年两年表型数据的次数分布图均呈单峰的正态分布,表明这三个性状是微效多基因控制的数量性状。果实纵径在2008年和2009年的广义遗传力分别为：91.1%和81.9%,果实横径在2008年和2009年的广义遗传力分别为93.2%和85.3%,说明2009年比2008年的环境效应大。将2008年和2009年共有的单株的果形和单果重数据做相关相分析,两年结果都表明,果实纵径和果实横径正相关(r>0.75)；果形指数与果实横径负相关(r-0.19；r=-0.17),与果实纵径正相关(r=0.48；r=0.42),且相关系数的绝对值纵径要比横径大,说明果形指数主要由果实纵径决定；果实大小与果实横径(r=0.87；r=0.89)、纵径均呈显著正相关(r=0.76；r=0.78),果实横径与果实大小的相关系数要比纵径与果实大小的相关系数大,表明果实大小主要取决于果实横径；果实大小与果形指数不相关(r=-0.033；r=-0.084)。分别用SSR(242个SSR标记)图谱和SNP(3476个SNP标记)图谱对2008年和2009年两年连续数据QTL分析,采用区间作图,SSR图谱在全基因组阈值LOD≥2.8下,果实大小、果实纵径、果实横径、果形指数共检测到19个QTLs,在SNP图谱全基因组阈值LOD≥3.5下,检测到16个QTLs。在单条染色体阈值条件下,SSR图谱中果实大小与果实纵径连锁的QTL有4个,与果实横径连锁的QTL有6个；果形指数与果实纵径连锁的QTL有2个,与果实横径连锁的QTL有1个。在全基因组阈值条件下SNP标记图谱中果实大小与横径重合QTL有1个；果形指数与果实纵径重合的QTL有1个；果实大小与果形指数不存在相关的QTLs。果实大小与果形指数不存在相关性,同时QTL也没有检测到二者重合或连锁的QTL,说明果实大小与果形指数属于不同的遗传基因控制。对遗传效应较大的QTLs(LOD>3.50)进行基因预测,最终得到与果实横径和单果重相关的基因3个,位于LG3上；果实纵径基因2个,位于LG7上；果形指数基因14个,位于LG11上。