自1980年第五届全国人民代表大会第三届会议通过以来,个人所得税法在我国已有40年的历史。随着我国社会主义经济的快速高效发展,税收制度的逐步完善,个人所得税已成为我国重要的税收来源。目前实行的最新个人所得税法于2018年第十三届全国人民代表大会常务委员会第五次会议通过《关于修改＜中华人民共和国个人所得税法＞的决定》第七次修正,这标志着我国首次建立综合与分类相结合的个税制度,于2019年1月1日开始实施。同时,2020年3月我国正式开启了年度个人所得税综合所得汇算申报,这意味着此次个税改革各项政策全面落地实施,意义重大。因而这对税务机关来说,是一次全新的挑战。面对个税首次综合所得汇算申报,税务机关对此各方面的管理都是全新的,因此税务机关也要面对接踵而至的各项挑战。本文将以H市为例,运用新公共管理理论、税收遵从理论、信息不对称理论等同时研究相关的税收政策分析目前H市个税综合所得汇算申报的现状,概括出“汇算申报信息不对称、汇算申报数据加工管理不到位、汇算申报特殊群体管理不到位、税务机关服务不到位以及纳税人汇算申报缺乏积极性”等,并深入研究了导致这些问题存在的原因,主要是由于个税综合所得汇算申报信息不完善、配套制度不健全、汇算申报管理对象存在难度、税务机关服务存在缺陷以及纳税人税收遵从度不高等原因。同时,首次的汇算申报加上新的个税改革为税务部门的管理带来了新的挑战。最后,就如何进一步更好的开展个税年度综合所得汇算申报这项工作提出了“夯实汇算申报基础数据、完善汇算申报配套机制、提高针对特殊群体申报管理水平、提高税务机关汇算申报服务水平以及提高自然人纳税人税收遵从度”的对策建议。