伴随工具理性负面影响出现的是人们对理性异化现象的反思。本文的写作核心是反思我国电子政务防腐体系建设中的工具理性取向,通过实证分析和理论分析相结合,以我国电子政务防腐体系建设在工具理性取向下所表现的优势与问题为主要研究内容,并与该体系在公共理性视域下的应然框架对比,为治理我国电子政务防腐体系建设中工具理性取向指明方向。研究表明,工具理性那种关注事实、技术和制度的特性,有利于将信息公开和公民参与这样的电子防腐核心问题的解决提到操作层面,赋予其现实意义；对公开和参与问题进行理性辩论,利于达成共识；把公开和参与问题纳入法制框架,实现对公民权益的强制保障。但当工具理性出现膨胀并占据统治地位后,它所表现出的极端功利特性阻碍电子防腐的信息和参与系统由封闭走向开放；惟效率特性阻碍公民参与的程度由表面走向深度；纯粹形式合理特性阻碍与信息和参与等相关的制度由形式正义走向实质正义。针对工具理性对电子政务防腐体系建设过程所带来的各种难题,分析出背后的根本原因是极端工具理性的各种特性对公共理性的电子防腐内核的粉碎和协商民主机制发展的限制,最终导致公共理性在电子政务防腐体系建设过程中的缺失。因此,需要培育公共理性的电子防腐内核,营造公开及理性的公共协商氛围；需要缔造公民社会独立成长的空间,营造积极有效的公民参与局面。本论文的核心结论是,治理我国电子政务防腐体系建设过程中的工具理性取向,要实现工具理性向公共理性的转变,实现工具理性和价值理性的有效整合。