【摘 要】
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tRNA是显著影响翻译的效率和准确性的重要因素之一。细胞中tRNA的配置及其对延伸率的影响是翻译研究的一个重要课题。在本研究中,我们利用酿酒酵母的ribosome profiling数据,
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tRNA是显著影响翻译的效率和准确性的重要因素之一。细胞中tRNA的配置及其对延伸率的影响是翻译研究的一个重要课题。在本研究中,我们利用酿酒酵母的ribosome profiling数据,分析了核糖体A位点上的密码子频率。结果表明,核糖体倾向于避免同时翻译大量相同的密码子,尤其是对应tRNA丰度很低的密码子。这种趋势在高核糖体密度的mRNA上非常明显,而在低核糖体密度的mRNA上不明显。为了解释这种翻译的偏好性,本研究构建了一个考虑tRNA竞争的翻译模型,并利用计算机模拟了翻译过程。结果表明,当随机打乱mRNA密码子顺序后,翻译速率显著下降,且这是由翻译过程中有效tRNA数量的降低引起的。据此,我们认为翻译过程中,对tRNA存在优化配置的过程,避免同时大量使用相同的tRNA,以减少核糖体对这些tRNA的竞争,从而降低核糖体碰撞概率,有利于高翻译速率的维持.
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