自我国实施经济体制改革以来,伴随产品市场价格双轨制的消失,其扭曲也逐步得到纠正,但仍然存在包括劳动力、资本、土地以及能源等在内的一系列生产要素市场扭曲。要素市场扭曲最主要的表现是要素实际价格与均衡价格的偏离,进而产生创新效率损失问题。而作为创新的核心主体,高技术产业的创新效率直接影响着我国经济发展方式向创新驱动转变的进程。本文基于重新测算的中国要素价格扭曲程度对高技术企业创新效率产生的影响进行理论和实证研究。本文在梳理总结文献的基础上通过C-D生产函数重新测算出我国各省际要素市场扭曲的程度,发现在研究期内我国要素市场扭曲问题在整体上未得到有效缓解;同时通过收集整理数据,对高技术产业的创新活动现状做出统计分析。然后构造包含了要素市场扭曲及互联网发展水平的知识生产函数,利用我国高技术产业2009-2016年省际面板数据并结合差分GMM和系统GMM方法对要素市场扭曲对高技术企业创新效率的影响及异质性做出实证分析。本文通过研究发现,我国要素市场扭曲的现状并未发生显著的一致性改善,我国仍普遍存在要素市场扭曲,并且资本市场扭曲程度较劳动力扭曲更严重。分别回归表明,劳动力市场扭曲与资本市场扭曲均对我国高技术产业创新效率产生较为显著的负向影响,仍然需要大力推动以资本市场为主的要素市场化改革,而互联网的发展可以促进高技术企业创新效率的提升,但要素市场扭曲显著抑制了这种效果。为此可以通过提升互联网发展水平、促进互联网与高技术企业深度融合、发挥企业规模效应以及提升企业外向度等措施来有效提升在要素市场扭曲背景下的高技术企业创新效率。