在育种中,准确记录系谱信息关系到育种进程。杂交亲本需根据系谱信息进行挑选,若系谱记录不准确,可能挑选到非目标性状的亲本,对杂交效果造成影响。本研究旨在通过对多个微卫星(STR)位点进行分析,筛选出排除概率高、多态性丰富、适用于鸡亲子鉴定的微卫星。使用所筛选STR检测育种群体的系谱记录错误率,为下一步育种工作提供参考,减少因系谱记录错误产生的经济损失。本研究的实验样品是N412品系全同胞家系,共552只鸡,父本11只,母本116只,子代425只。用20个STR对这些个体进行基因型分析,排除峰图不易判断的位点,筛选出可扩增的多态性位点。将筛选出的多态性位点按照排除概率由大到小排列,计算多个位点的联合排除概率。根据联合排除概率与实际操作情况确定适合鸡亲子鉴定的STR。主要研究结果如下:20个STR均为多态性位点,其中16个STR峰图清晰易辨,可用于亲子鉴定;4个STR基因型判定容易出错,将这4个位点剔除。16个STR的平均等位基因数为8.063;平均观察杂合度为0.668;平均期望杂合度为0.705,平均多态信息含量(PIC)为0.667。16个位点中仅MCW0080与MCW0206是中度多态性位点,其他都是高度多态性位点。将16个STR按排除概率由大到小排列,计算多个位点的联合排除概率,当联合位点数为6时,CEP-PP大于99.99%;当联合位点数为9时,CEP-1P、CEP-2P、CEP-PP分别大于99%、99%、99.99%;当联合位点为12时,CEP-1P、CEP-2P、CEP-PP分别大于99%、99.99%、99.99%。实际操作中少数STR可能没有扩增出条带,为增加鉴定的准确性,认为12个STR适合进行鸡亲子鉴定。用12个STR对采集样品进行亲子鉴定并与系谱进行对照,发现母权鉴定结果、父权鉴定结果、父母对(性别已知)鉴定结果与系谱的匹配率分别为92.14%、93.18%、91.76%。结论:本研究筛选并鉴定了可适用于鸡亲子鉴定的12个微卫星分子标记(MCW0120、MCW0145、LEI0094、MCW0217、MCW0295、LEI0234、MCW0134、MCW0111、MCW0123、MCW0032、ADL0210、MCW0330)。