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水产养殖池塘是一种受到高强度人为干预的生态系统,其中的微生物对过多营养物质的输入具有直接的响应,同时这些微生物是代谢这些过多营养物质的最重要的生物类群。因此,研究水产养殖池塘中微生物群落状况对于了解养殖过程对池塘生态功能和池塘的环境承载力的变化具有重要的意义。既2007年以后,罗非鱼成为继鲢、鳙、草、鲤、鲫之后我国第六大淡水养殖品种,其中池塘集约化养殖产量一度占到总产量的约50%,因而,池塘集约化养殖罗非鱼在我国淡水养殖中占有重要位置。有鉴于此,本试验采用高通量测序技术对罗非鱼养殖池塘中细菌群落、古菌群落和真菌群落结构状况进行了研究,采用荧光定量PCR技术对不同密度罗非鱼养殖池塘中氨氧化细菌、古菌的动态变化进行了研究,采用分离、培养的方法对罗非鱼养殖池塘中分离到的3株异养硝化细菌的无机氮利用特性进行了研究,以期为有关研究提供基础数据。1吉富罗非鱼养殖高峰期池塘细菌群落的空间分布状况研究对吉富罗非鱼（Oreochromis niloticus）养殖高峰期池塘细菌群落的空间分布状况进行了研究,结果表明,放线菌门（Actinobacteria）、变形菌门（Proteobacteria）、蓝细菌门（Cyanobacteria）和拟杆菌门（Bacteroidetes）是水中的优势菌群,变形杆菌（Proteobacteria）、拟杆菌门（Bacteroidetes）和绿弯菌门（Chloroflexi）是表层沉积物中的优势菌群,梭杆菌门（Fusobacteria）、变形菌门（Proteobacteria）和厚壁菌门（Firrmicutes）是末端肠道中的优势菌群;对这三种介质中细菌群落丰富度和多样性的研究表明,表层沉积物中细菌群落丰富度和多样性均最高;通过共有OTU数目比对发现,表层沉积物样品和罗非鱼末端肠道样品间具有更多的共有OTU,表明这两类介质可能存在着更多的细菌交流。2水葫芦栽培对吉富罗非鱼养殖池塘浮游细菌群落的影响研究试验对比了水葫芦栽培区和敞水区水样中浮游细菌群落的差别,结果表明吉富罗非鱼养殖池塘中水葫芦栽培区的蓝细菌门（Cyanobacteria）的相对丰度显著高于敞水区,蓝细菌门相对丰度的增加降低了其他一些主要门类的相对丰度份额；水葫芦栽培区细菌群落丰富度和多样性均低于敞水区;水中叶绿素a和亚硝酸盐氮的浓度与水葫芦栽培池塘（养殖吉富罗非鱼）中细菌群落丰富度和多样性呈负相关。3不同密度吉富罗非鱼养殖池塘水质、底质及罗非鱼生长性状差别对比了3口不同养殖密度吉富罗非鱼养殖池塘（养殖密度分别为18000、22500和27000尾/公顷,其他条件均一致）养殖过程中水质、底质的差别,以及养殖结束罗非鱼成鱼生长性状的差别。结果表明,随着时间变化3口池塘水质和底质状况出现明显变化,但在3口池塘间水质差异不显著,底质状况则存在着显著差异;不同的养殖密度不仅使得获得的成鱼规格明显不同,通径分析还表明其他生长性状对体重的决定作用也明显不同。因此,不同的养殖密度对罗非鱼养殖池塘中理化要素和生物要素都造成了影响。4不同密度吉富罗非鱼养殖池塘细菌群落的动态变化随着时间变化（5月份、7月份、9月份和10月份）,水中浮游细菌主要群落组成大体上是稳定的,但相对丰度是不断变化的。其中变形菌门（Proteobacteria）的相对丰度相对稳定,蓝细菌门（Cyanobacteria）和放线菌门（Actinobacteria）的相对丰度变化比较剧烈。同样随时间变化,浮游细菌丰富度先升高后降低,最高在9月份,而多样性指数不断升高;在不同池塘间,多数"门"水平的细菌组成没有显著差异,只有蓝细菌门（Cyanobacteria）的相对丰度在5月份在不同池塘间存在差异,放线菌门（Actinobacteria）的相对丰度在7月份随着养殖密度升高而升高。同样在不同池塘间,浮游细菌丰富度和多样性差异均不显著。基于细菌群落结构的水样样品相似性分析也表明,时间变量是造成水样样品分组的主要因素。表层沉积物中主要细菌群落结构随时间变化表现出比水中的群落结构更为稳定。相对丰度排在前四位的一直是变形菌门（Proteobacteria）、拟杆菌门（Bacteroidetes）、绿弯菌门（Chloroflexi）和酸杆菌门（Acidobacteria）。表层沉积物中细菌群落丰富度随着时间变化而升高,多样性指数随着时间变化先升高后降低,7月份最高;在不同池塘间,细菌群落丰富度差别不显著,但群落多样性有显著变化,在5月份和7月份随着养殖密度升高,多样性指数先升高后降低,在9月份和10月份则随养殖密度升高而降低。基于细菌群落的沉积物样品相似性分析表明,池塘变量（包含养殖密度、饵料系数等）是影响样品分组的主要因素。5不同密度吉富罗非鱼养殖池塘古菌群落的动态变化吉富罗非鱼养殖池塘中,无论是水中还是表层沉积物中的古菌群落在"门"水平均包括广古菌门（Euryarchaeota）、泉古菌门（Crenarchaeota）、奇古菌门（Thaumarchaeota）和一些门未定类群。其中以广古菌门（Euryarchaeota）居于绝对优势地位、其次是奇古菌门（Thaumarchaeota）。对比水和表层沉积物样品中“科”、“属”水平的优势种类表明,广古菌门（Euryarchaeota）中的DeepSeaHydrothermalVentGp6（DHVEG-6）n--orank科、Methanosaeta、MarineBenthicGroupDandDHVEG-1norank、Methanoregula、Methanomicrobialesunclassified在水和表层沉积物中都具有较高的丰度,表明它们对池塘罗非鱼集约化养殖具有明显的响应。随时间变化,水中古菌群落丰富度和多样性呈逐渐下降趋势,但不同池塘间差异均不显著;表层沉积物中古菌群落丰富度和多样性均受到池塘变量和时间变量的双重影响。随时间变化,表层沉积物中古菌丰富度和多样性均呈增加趋势;随着养殖密度的增加,古菌群落丰富度和多样性也呈增加趋势。基于古菌群落的样品相似性分析表明,时间变量对水样的分组起主要作用;表层沉积物样品分组不明显,但相对来讲不同养殖密度的池塘变量具有使样品产生分组的趋势。6不同密度罗非鱼养殖池塘真菌群落的动态变化本次试验表明,罗非鱼养殖池塘系统（水和表层沉积物）中大部分水生真菌在选用Unite数据库的情况下不能得到注释。对已经注释的真菌群落进行分析表明,水和表层沉积物中都是担子菌门（Basidiomycota）相对丰度最高,子囊菌门（Ascomycota）次之。随时间变化,水中真菌群落丰富度和多样性均呈先下降后上升的趋势;随着养殖密度的增加,水中真菌的丰富度和多样性均呈先上升后下降的趋势。基于真菌群落的样品相似性分析表明,时间变量是决定水样样品分组的主要因素;对于表层沉积物样品来说时间变量和不同养殖密度的池塘变量对样品的分组都有重要的影响。7不同密度罗非鱼养殖池塘氨氧化细菌/古菌氨单加氧酶基因的动态变化不同密度罗非鱼养殖池塘中,水中氨氧化细菌氨单加氧酶基因的拷贝数随之间变化呈先下降后上升的趋势,但在不同池塘间差异不显著;表层沉积物中的氨氧化细菌氨单加氧酶基因拷贝数受到时间变量和池塘变量的双重影响,随时间变化,呈升-降-升的波动式变化。在不同池塘间,随养殖密度增加呈增加趋势。时间变量和池塘变量对水中氨氧化古菌氨单加氧酶基因拷贝数的影响与对氛氧化细菌氨单加氧酶基因的影响类似。随时间变化,氨单加氧酶基因拷贝数呈现先增加后降低的趋势,但在不同池塘间差异不显著;表层沉积物中,其随时间变化呈先增加后降低的趋势。在不同池塘间,其随养殖密度增加呈现增加趋势。通过对氨氧化细菌/古菌氨单加氧酶基因拷贝数比值的研究,表明无论是在水中还是在表层沉积物中氨氧化古菌amoA基因拷贝数都大于氨氧化细菌amoA基因的拷贝数。8罗非鱼养殖池塘中异养硝化细菌的分离及无机氮利用特性研究从处于养殖高峰期的吉富罗非鱼精养池塘中富集、分离得到3株异养硝化细菌HLf01、HBfD1和HHf01,经16S rDNA序列比较、细菌形态学分析及生理生化指标试验,确定菌株HLf01和HHf01为假单胞菌属（Pseudomonas sp.）,菌株HBf01为鲍曼不动杆菌（Acinetobacter baumannii）。研究表明这3株细菌在无机氮利用及有机碳消耗上存在着显著的差别。将其分别接种到水产养殖用水中,加入有机碳后表明,3株细菌可以不同程度地控制水体氨氮的增加。