转录组测序联合TCGA-BLCA数据库筛选膀胱癌预后相关分子标记物

来源 :昆明医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wyj8332606
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[目的]运用第二代测序技术联合TCGA-BLCA数据库,从转录组层面筛选出膀胱癌预后相关的分子标记物,并探讨其调控膀胱癌进展的可能分子机制。[方法]收集2018年6月到2018年12月期间昆明医科大学第二附属医院泌尿外科行膀胱癌根治性切除术患者癌组织及癌旁组织进行转录组测序,测序结果联合TCGA-BLCA数据库,筛选关键预后基因,探讨这些基因在膀胱癌发生发展过程中的分子机制及临床意义。[结果]1.筛选出17个关键预后基因:ACOX2,ACTA2,ADRA2A,ATP1A2,BUB1B,CCL19,CXCL2,FOXM1,ITGA8,MAD2L1,MAP3K20,MCM4,NPR1,ORC1,PLK4,RASGRP2,TGFB3,这些基因主要参与内分泌系统,信号转导和细胞生长/死亡所涉及的通路。2.关键预后基因FOXM1显著影响膀胱癌患者总生存和无进展生存,差异有统计学意义(P<0.05)。3.FOXM1的临床病理特征:FOXM1与临床变量线性回归和Logistic回归均显示:年龄和分期与FOXM1之间有显著的关系(P<0.05),性别、BMI、吸烟史、每年吸烟包数、淋巴结数与FOXM1无显著相关(P>0.05);FOXMI和临床变量与总生存、无进展生存显著相关(P<0.05),高表达的FOXM1是总生存和无进展生存的风险因素。校正年龄和分期后,FOXMI与总生存和无进展生存无显著相关性(P>0.05)。FOXM1与年龄的交互作用显著增加患者无进展生存的风险(P<0.05),FOXM1与疾病分期的交互作用显著增加患者总生存和无进展生存的风险(P<0.05)。4.FOXMI转录调控:FOXM1受上游基因E2F1和SP1的正调控,并导致下游CCNB1、CDC6等基因的高表达,这些基因主要参与细胞周期、p53信号通路和FoxO信号通路,这些通路的上调可能会导致膀胱癌进展。[结论]1.ACOX2,ACTA2,ADRA2A,ATP1A2,BUB1B,CCL19,CXCL2,ITGA8,MAD2L1,MAP3K20,MCM4,NPR1,ORC1,PLK4,RASGRP2,TGFB3 基因只影响总生存或无进展生存中的一方面。2.FOXM1同时影响总生存和无进展生存,可作为膀胱癌预后的分子标记。3.FOXM1主要受到E2F1和SP1的正调控,并导致下游CCNB1、CDC6等基因的高表达,这些基因主要参与细胞周期、p53信号通路和FoxO信号通路,从而影响膀胱癌进展。
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