斑马鱼早期心脏发育基因的功能研究及发育关键时间点转录组学分析

来源 :上海海洋大学 | 被引量 : 2次 | 上传用户:mcl8023
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心脏是脊椎动物中最早形成并行使功能的器官之一。在其发育过程中,心管经过复杂的环化过程,形成心房和心室间隔即(atriovent ricular canal,AVC),进而形成心脏的腔室结构,发育成有功能的心脏。AVC形成过程受到多种信号通路调控。心脏瓣膜(Cardiac valv es)的发育过程是高度有序且精细的,以便确保血液流向腔室和血管。TBX家族中,Tbx2,Tbx5和Tbx20是房室间隔形成的关键基因。之前的报道表明Tbx2抑制腔室的分化和增殖,从而使腔室之间有序收缩。Tbx5的突变,会导致人类常染色体显性遗传病心手综合征(Holt-Oram syndrome,HOS)。小鼠Tbx20突变体中早期心管的发育基本正常,但是后续的心脏环化过程异常。斑马鱼体外受精,并且早期胚胎发育透明便于观察,是研究心脏早期发育和先天性心脏病致病机理的理想模式动物。本研究利用CRI SPR/Cas9基因编辑系统成功获得斑马鱼tbx2b,tbx5a和tbx20基因的突变鱼系,T7E1检测3种鱼系F0突变效率分别约为57.5%、38.0%、42.1%。测序分析F1中突变类型,tbx2b F1获得-11 bp和-20 bp的突变携带者,tbx5a F1获得-10 bp和+10 bp的突变携带者。tbx20F1获得-8 bp的突变携带者。在tbx20 F2突变体中观察到心脏突变表型:48 hpf,tbx20突变体可见心脏结构拉伸变形,环化异常,心包腔肿大;3 dpf,突变表型逐渐加深,心脏拉伸成细线状。荧光定量PCR结果显示tbx20突变体中lef1,nppa和has2的表达下调。此外,本论文利用肌球蛋白轻链7绿色荧光标记的转基因鱼系成功分离出24 hpf、30 hpf、36 hpf、48 hpf 4个不同发育时期的斑马鱼心脏,并进行转录组测序分析。我们初步发现有488个转录因子在心脏早期表达呈明显差异,其中包括:T-box家族、GATA家族、Nkx家族和bHLH家族中多个基因。在信号通路方面的分析,KEGG结果显示了差异基因主要富集一些信号通路,如Notch、Wnt、TGF-beta等。本研究成功制备斑马鱼tbx2b、tbx5a和tbx20突变体鱼系,并发现tbx20基因突变会影响心脏环化及AVC的发育,为深入探究tbx2b,tbx5a和tbx20基因在早期心脏发育的功能奠定基础。本论文比较系统的分析出4个关键心脏发育阶段的差异表达基因,为研究早期心脏发育阶段的调控关系奠定基础。
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