大豆花叶病是世界范围内对大豆破坏最强的病害之一,严重影响着大豆的产量。在目前获得广泛认可的3个大豆抗SMV位点中,Rsv3被定位到14号染色体(B2连锁群)上,位于A519和M3Satt之间。在A519和M3Satt间154.1kb大豆基因组序列中,有5个CC-NBS-LRR型抗病基因(含卷曲螺旋、核苷酸结合位点和富亮氨酸重复三个结构域)。分别在Rsv3位点上这5个基因的5’UTR和3’UTR区域设计特异性引物,对科丰一号、齐黄一号、Davis、广吉、早熟18、8101、诱变30、南农1138-2、苣选23和Columbia等10个大豆品种进行全基因扩增,共获得46条Rsv3位点上的基因序列,分别为10条14g38500、10条14g38510、9条14g38540、7条14g38560和10条14g38590。将这46条基因与大豆基因组数据库中Rsv3位点的5条基因一起作序列比对和系统进化分析,发现Rsv3位点上的5个基因可以分为两个类群,第一类为14g38500和14g38510,这两个基因在10个大豆种质中保持高度的序列一致性；第二类为14g38540、14g38560和14g38590,这三个基因明显受到正选择的作用。与不含有Rsv3位点的大豆种质相比,Zaoshu18和Columbia中14g38540的同源基因序列突变位点保持较高的一致性,推测14g38540很可能是Zaoshu18和Columbia在Rsv3位点上的抗SMV的候选功能基因。同时Zaoshu18和Columbia中都丢失了14g38560的同源序列,通过序列比对和基因重组分析,发现Zaoshu18和Columbia中的14g38540是由14g36540和14g38560序列交换后形成的重组子。