喉癌及癌旁组织中长链非编码RNA(LncRNA)的差异表达及意义

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目的:筛选分析喉癌及对应的癌旁组织的长链非编码RNA(LncRNA)的表达差异性,探究差异表达的LncRNA的临床意义,为寻找喉癌新型诊断指标以及治疗的改善提供新线索。  方法:利用基因芯片技术检测6对喉癌及相对应的癌旁组织中LncRNA的差异表达情况,构建Incrna的差异表达谱,利用生物信息学手段对差异表达的LncRNA进行分析,筛选出具有显著表达差异(Fc>2.0,P≤0.05)的LncRNA,再利用实时荧光定量PCR技术验证在38对喉癌以及相对应的癌旁组织中验证芯片结果中部分具有显著差异表达的LncRNA(NR_024065.2、TCONS_00010350、ENST00000438554.1、ENST00000434656.1),以进一步验证基因芯片实验结果,并将其表达与临床病理特征相结合,寻找4个差异表达的LncRNA与临床病理特征的关系。  结果:6对喉癌及相对应癌旁组织相比,有4477个差异表达的LncRNA,其中有748个LncRNA表达上调和3729个LncRNA表达下调。选择4个差异表达的LncRNA: NR_024065.2、TCONS_00010350、ENST00000438554.1、ENST00000434656.1进一步扩大样本量进行验证,结果显示在38对喉癌及相对应癌旁组织中NR_024065.2、TCONS_00010350、ENST00000438554.1、ENST00000434656.1具有差异表达(P值分别为0.0202、0.0384、<0.0001、<0.0001,均小于0.05)且表达水平下调,与芯片检测的表达趋势相符。  结论:研究发现NR_024065.2、TCONS_00010350、ENST00000438554.1、ENST00000434656.1在喉癌、癌旁组织中表达,且喉癌组织较癌旁组织表达下调。
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