仙人洞自然保护区地理位置独特,处于东北和华北两大动、植物区系的交汇地带,物种资源丰富、地理成分复杂。目前尚未有该保护区的生物多样性评价,为了得到准确的生物多样性评价,更加合理、科学的保护其生物多样性,本文通过资料收集、实地调研、数据整理和分析等方法,在2009年环境保护部颁布的《中华人民共和国环境保护标准》——生物多样性评价标准的基础上,结合研究区域的特征,确定了野生维管束植物丰富度、野生高等动物丰富度、生态系统类型多样性、物种特有性、外来物种入侵度和受威胁物种丰富度6项评价指标,首次对仙人洞自然保护区的生物多样性进行评价。经调查,仙人洞自然保护区有野生维管束植物831种(包括变种和变型),野生高等动物375种,中国特有物种12种,外来入侵物种18种,受威胁物种56种,其中国家一级保护动、植物8种,经计算得出仙人洞自然保护区的生物多样性指数是30.311,评价结果为“中”。评价结果表明：(1)单位面积的野生动植物资源极其丰富；(2)生态系统类型相对复杂、多样,为生物提供了良好的生活环境；(3)中国特有属、种相对较少；(4)存在一定的外来物种入侵威胁；(5)受威胁物种种类繁多,亟待得到进一步保护。本研究不仅为辽宁省生物多样性调查研究提供了理论依据,也全面了解了保护区的生物多样性现状,便于制定更加科学、完善的规章制度,有针对性的进行生物多样性的保护,在保证生物多样性得到保护的前提下,合理适度的进行开发,为自然保护区的可持续发展提供科学、合理的保护策略和开发建议。