近年来,上市公司对外披露的各种报表,尤其是内部控制评价报告越来越科学和完善。国内外的各个领域专家对内部控制及其缺陷的研究越思路也来越清晰,研究方式和手段也越来越科学。但是,对于近几年的上市公司内部控制评价报告来说,内部控制缺陷始终是一个顽疾,一直存在于内部及控制中,严重的影响着整个上市公司的市场秩序,并且危害着公司股东及员工和投资者的利益。论文则着重关注了上市公司的内部控制缺陷,从内部控制缺陷的定义划分以及其发生原因等角度分析,并研究了有代表性的山东R集团,比较其近几年的内控缺陷,研究其一般缺陷、重要缺陷和重大缺陷的特征及该企业的整改方法。在研究与调查过程中发现,该公司的内部控制缺陷主要分为设计环节缺陷和运行环节缺陷,存在例如销售环节不规范、披露信息不规范、利润派发不规范、核算方法不规范等问题。为了解决这一问题,该公司采取了多种措施。论文主要研究山东R集团整改过程中的问题,分析某些缺陷整改情况不乐观的原因。由于这些原因导致其在整改之后依然存在重大缺陷,严重影响了股东及相关利益集团的整体利益,需重点关注。因此,论文从从集团设计与运行两个角度出发,全面具体的分析案例公司,并总结其整改效果,为其他上市公司的内控缺陷的整改提出合理的意见,并为相关监管部门提出科学的建议。同时,论文研究采用了文献查阅法、比较分析法及案例分析法的研究方法,以现代管理理论与委托代理理论的基础原理作为理论指导,对内部控制缺陷进行深入并且透彻的研究,为以后上市公司内部控制缺陷的整改提供了经验。