基于TCGA和GEPIA数据库分析SMOX基因在肝癌中的表达及其临床意义

来源 :中国医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:yigeyige
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目的:通过获取TCGA和GEPIA数据库中的相关数据,分析精胺氧化酶(SMOX)基因在肝癌中的表达及其临床意义。方法:本文基于TCGA和GEPIA数据库收集了肝癌患者临床数据和SMOX mRNA表达数据,使用R软件4.0.3版本对获得的数据进行系列分析。T检验分析SMOX mRNA在肝癌组织与癌旁组织表达的差异,单因素方差分析比较SMOX基因在不同临床分期的表达差异,Kaplan-meier方法用来分析肝癌患者的生存,COX单因素及多因素分析SMOX mRNA表达以及其它一些临床特征对肝癌患者生存预后的影响。结果:本研究从TCGA数据库网站中提取了371例肝癌患者和其对应50例癌旁组织的临床数据以及SMOX mRNA表达数据。研究表明肝癌组织中SMOX mRNA的表达明显高于癌旁组织(P<0.05)。肝癌不同临床分期SMOX基因表达差异显著(P<0.05),I期患者SMOX基因表达量最低,而Ⅳ期患者SMOX基因表达量最高。SMOX mRNA表达与肝癌的T分期和TNM分期有明显相关性(P<0.05)。研究发现SMOX mRNA的表达与肝癌的总生存密切相关(P<0.05),低表达组的总生存时间明显长于高表达组。COX多因素分析提示SMOX mRNA表达状态是预测预后指标之一。结论:肝癌组织中SMOX mRNA呈高表达,高表达的SMOX mRNA与肝癌患者的不良预后相关。SMOX有可能成为新的肝癌诊断与治疗的分子靶点。
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