物种的生物复杂性与非编码区域的长度高度相关，越高等的生物体非编码序列所占的比例越大。然而，以往的研究大多数把重点放在了编码区基因的功能研究上，而却忽视了非编码区的作用，甚至很长一段时间，人们认为非编码区是“垃圾”。重复序列在非编码区中非常常见，它们在基因表达、调控和遗传等方面起着十分重要的作用,并且重复序列表现出很强的规律性，因此从重复序列出发来研究非编码DNA序列有可能成为研究非编码区的突破点。本文主要是利用统计方法来分析重复序列,挖掘重复序列的分布规律，筛选出可能具有生物学价值的非编码DNA序列，进而探索研究非编码DNA序列的新的想法与思路。通过统计分析发现，已知的转录因子结合位点几乎全部包含在我们找到的重复序列中，其在基因组上出现位置间隔可以用几何分布很好的拟合；在同一个非编码区重复的最大次数和重复序列的长度密切相关；重复序列的位置分布也具有很强的偶联性，通过进一步的统计分析我们得到了偶联序列。生物学家从我们分析得到的重复序列中根据经验挑选了一些最有可能具有某些生物功能的片段进行了实验研究，初步证实它们确实具有一定的生物学功能。