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该文的研究目的是利用抑制消减杂交技术筛选人原发性肝细胞癌(以下简称肝癌)中差异表达的基因,为肝癌发生发展机理的阐明提供实验依据,并为肝癌的预防、诊断、治疗提供候选基因,研究工作的主要内容可以分为两个部分,第一部分为人肝癌中差异表达基因的筛选及部分有意义基因的分析;第二部分为肝脏特异表达的肝癌相关新基因HCC-C11的克隆、鉴定及功能分析.在第一部分的工作中,我们采用一例早期高分化肝癌作为材料,应用抑制消减杂交(Suppression subtractive hybridization,SSH)技术,分别以肝癌及癌旁组织作为检测者(tester),相应的癌旁及癌组织作为驱赶者(driver),进行了正向及反身消减杂交,结合Reverse Northern blot筛选,得到多个差异表达的基因.对有意义的基因用半定量RT-PCR检测了在肝癌中的表达.在第二部分的工作中,我们利用RACE,RT-PCR及生物信息学知识,对来自肝癌组织的一个差异表达片断C11进行了全长基因的克隆,并将全长基因命名为HCC-C11,同时克隆到了它的3个剪切变异体(HCC-CLL_v1,HCC-C11_v2,HCC-CLL_v3).Northern blot验证了基因的存在及转录本的大小.HCC-C11基因定位于染色体8q24.2,由2个外显子组成,HCC-C11_v1由3个外显子组成,HCC-C11_v2由2个外显子组成,HCC-C11_v3仅由1个外显子组成.HCC-C11及其3个变异体的cDNA全长分别为807bp,1146bp,1335bp,1560bp.4个转录本的最长开放阅读框架相同,均为234bp,编码77个氨基酸,与日前GenBank中的任何蛋白都没有同源性.启动子区转录因子结合位点分析显示HCC-C11与甲胎蛋白及白蛋白有多个相同的转录因子结合位点,主要是Homeodomain转录因子家族.用RT-PCR方法检测了HCC-C11在17种正常组织,10份肝癌,8种肝癌细胞系,4份肺癌,4份胃癌,4份结肠癌及5份卵巢癌中的分布,显示HCC-C11仅在肝脏、睾丸、肝癌组织及部分肝癌细胞系中表达,是一个肝脏特异表达的基因.用Real-time RT-PCR检测了HCC-C11的51份肝癌,10份肝硬化,10份正常肝组织中的表达.