新疆脾虚湿盛证寻常型银屑病维吾尔族与汉族在IL23/Th17通路基因易感性研究

来源 :新疆医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zhshgu1983
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目的:银屑病为一种慢性复发性疾病,目前考虑跟遗传免疫最为相关。银屑病又分为寻常型银屑病,脓疱型银屑病,红皮病型银屑病,关节型银屑病,此病全球患病率较高,并处于逐年递增趋势。发现新疆地区脾虚湿盛证患者占银屑病总数将近一半,本课题基于对新疆维吾尔族与汉族的差异性,以新疆少数民族资源为基础,搜寻和鉴定汉族、维吾尔族发病过程中在IL23/Th17信号通路基因上位性作用模型。  方法:收集3例典型维吾尔族寻常型银屑病脾虚湿盛证患者血液标本,3例健康维吾尔族血液标本,将血液标本通过提取、定量、质检等过程,通过Agilent技术进行离心、合成,荧光标记,采用 Feature Extraction软件(version10.7.1.1, Agilent Technologies)处理原始图像提取原始数据。接着利用 Genespring软件(version13.1, Agilent Technologies)进行quantile标准化和后续处理。标准化后的数据进行过滤,在用于比较的每组样本中至少有一组100%标记为Detected的探针留下进行后续分析。利用T检验的p值和倍数变化值进行差异基因筛选,筛选的标准为上调或者下调倍数变化值>=2.0且P值<=0.05。接着,对差异基因进行GO和KEGG富集分析,以判定差异基因主要影响的生物学功能或者通路。最后,对差异基因进行非监督层次聚类,利用热图的形式展示差异基因在不同样本间的表达模式。最后通过差异对比,筛选出相关基因。  结果:  1.通过差异筛选分析,实验共筛查出227个差异基因,其中上调表达基因120个,下调基因表达107个;  2.白细胞抗原信号通路中的HLA-A与癌症中的转录错误调控信号通路中的MPO表达较高。  结论:脾虚湿盛证寻常型银屑病维吾尔族患者在存在易感基因。
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