经济的高速发展和人口的持续增长给环境带来了巨大的压力。根据环境承载力理论，控制污染物排放总量是改善环境质量的根本措施。作为一项最为严格的环境管理制度，总量控制已经涵盖化学需氧量、氨氮、二氧化硫和氮氧化物4项指标。除了工程减排、结构减排和管理减排等措施外，依靠市场来配置环境资源的环境经济手段越发受到重视。其中，排污权交易制度是当前国家正在试点的环境经济手段。重庆市作为国家排污权交易制度的试点城市之一，需要在排污权交易的法规制度、体制机制、初始分配、交易定价和市场监管等诸多领域展开研究和示范。本文以重庆市排污权交易制度试点的实际需求为目标，对大气二氧化硫和氮氧化物交易的定价问题进行了如下研究并获得了相关结果。（1）对现有排污权交易理论，排污权定价原则、影响因素和常见的排污权定价方法进行了比较分析，认为治理成本是决定排污权交易价格的基础，除此之外,经济总体水平、环境质量状况等地区因素也会对排污权产生一定影响；结合重庆市具体情况和可操作性，确定恢复成本法为重庆市二氧化硫和氮氧化物排放权交易定价方法。（2）为了获取重庆市二氧化硫和氮氧化物的削减成本，开展了治理成本调查，包括二氧化硫、氮氧化物处理技术、处理成本及其构成等；通过对调查结果的分析统计获得重庆市二氧化硫和氮氧化物的削减成本分别为1929元/吨和3771元/吨。根据二氧化硫削减成本与其排放浓度的负相关，计算出二氧化硫的达标削减成本和深度削减成本分别为1954元/吨和2737元/吨。（3）建立了以恢复成本法为基础的重庆市主要大气污染物排污权定价模型，并分析了影响重庆市大气污染物排污权定价的因素；根据重庆市的实际情况，确定了经济水平系数、环境容量调整系数、排放效率调整系数和机会成本调整系数分别为1，1.08，1.026，,13.1%和1，1.5,1.063，13.1%；得出重庆市二氧化硫和氮氧化物交易基准价分别为2500元/吨和7000元/吨。（4）在排污权交易中监督监测、排放指标管理、交易评估和奖惩制度等方面做出了建议。