课题使用已测序的五种蔷薇科植物(桃、苹果、草莓、梨、梅)的全基因组作为研究对象,以双子叶植物代表葡萄基因组为外类群,对多物种进行联合比对,构建以葡萄和桃基因组为参考的共线性列表;结合同源片段的分类统计,从基因组丢失与保留的角度分析蔷薇植物的基因组进化过程。通过搜索基因组间和基因组内的同源片段,获得同源共线性信息。以基因组内与基因组间的直系基因和旁系基因为基础,构建以葡萄、桃基因组为参考的蔷薇科同源联合比对图谱;通过比对分析,确定各个蔷薇科植物基因组加倍的规模,获得不同进化事件的基因对集合。根据同源关系确定基因组进化过程,推测苹果基因组在加倍前有9条染色体;说明多倍化过程可能是基因组重组的原因之一;基于基因组内、间同源基因的同义核酸替换率Ks的分布,我们推断苹果与梨基因组共同的全基因组加倍事件发生在~16.7 Mya。