新疆地处中国西北边陲，是我国重要的能源基地，是西部经济增长的重要支点，是我国向西开放的重要门户，是我国西北战略的重要屏障。改革开放以来，新疆依照国家经济发展的战略，实行了非均衡发展的战略。在此非均衡发展战略实施之后，虽然新疆整体经济实力不断增强，但各区域之间的经济差异却是愈来愈大。由此引发的各区域之间经济发展不协调的矛盾日渐突出，这不仅关系到新疆国民经济的总体发展、社会稳定和民族团结，而且还关系到我国的边疆的稳定和安全。因此，我们希望通过对新疆南北疆区域经济差异进行的研究，来挖掘导致其经济差异关键因素的所在。并以此为指导，来有针对性地制定缩减南北疆差异的政策，使其区域经济发展逐渐趋于协调。　　研究方法上，本文以区域经济学、产业经济学相关理论为理论基础，首先对新疆南北疆经济发展现状进行简单描述；其次，在此基础之上，利用单指标不平等指数法、因子分析法、聚类分析法对新疆南北疆区域经济差异现状进行了实证分析；再次，对导致新疆南北疆区域经济差异的种种因素进行了假设，并对此假设进行了相关的回归分析，以印证该假设的准确性。最后，针对新疆南北疆区域经济差异的现状及其影响因素，提出了有针对性的政策措施。　　本文通过分析研究得出以下主要结论有：第一，从新疆南北疆13地、州近12年的经济差异变化趋势也可以看出，虽然其绝对差异和相对差异都在增长，但绝对差异增长速度比相对差异增长速度要快；第二，对于南北疆而言，无论从动态角度还是静态角度，北疆经济发展水平明显高于南疆地区；第三，市场化水平、工业化水平、劳动力参与率、初始人力资本禀赋、投资率是导致新疆区域经济差异不断扩大的主要影响因素。基于萨拉-伊-马丁的模型，实证检验了1999—2010年以来，工业化水平（产业结构的转换）和投资率是导致南北疆区域经济差异不断扩大的主要原因。　　基于上述研究成果，本文提出了缩减南北疆区域经济差异的相应对策。