新三板市场诞生于2013年1月16日,通过不断地扩容与改革,完成了基础制度设计,基础设施构建和初始规模累积,成为我国多层次资本市场的不可缺失的一部分。与此同时,新三板市场流动性不足的问题愈发凸显。2018年1月15日起,新三板盘中交易由协议转让调整为集合竞价,试图通过交易机制的改变来改善新三板市场流动性差的状况。在此政策背景下,系统、深入分析集合竞价交易制度与新三板流动性变化的关系,对于交易制度充分发挥对市场流动性的促进作用和推动新三板市场健康发展具有重要的现实意义。文章以金融市场微观结构理论为基础,分析了集合竞价交易制度的引入对市场流动性的影响效应,并利用换手率和买卖价差指标对股票流动性进行量化,加入政策虚拟变量和时间虚拟变量进行实证检验。首先利用倾向匹配得分模型对实验组进行样本匹配得到对照组,其次采用双重差分模型实证分析集合竞价交易制度的引入对新三板市场流动性变化产生的净效应。实证结果显示:集合竞价交易制度显著减弱了新三板市场股票的流动性,且对不同层次流动性影响程度不同。导致政策有效性不足的原因有:改善市场流动性并非集合竞价交易制度的直接目标;新三板引入集合竞价交易制度时机不当;当前订单撮合频率不能满足市场需求;市场存量退出渠道不通畅阻碍新三板市场发展。为提高新三板市场流动性,应推进市场精细化分层,完善交易制度建设,同时丰富市场参与主体,并建立双向转板机制。