种业是我国的基础性和战略性产业,农业现代化的实现和国家粮食安全的保障离不开种业的发展。而发展现代种业离不开种业企业的发展,提升种业企业的技术创新能力,培育具有国际竞争力的创新型现代种业企业势在必行。自2000年种子法实施以来,我国种业市场全面放开,种业企业得到发展壮大,种业企业的科研投入和产出不断增长。然而,同大型跨国种业企业相比,我国种业企业的技术创新水平和市场竞争力还相距甚远。要增强种业企业的科技经济实力,必须提高其技术创新效率。了解我国种业企业的技术创新效率现状及其形成原因,并明确其影响因素,有利于政府和企业采取更有效的措施来提升种业企业的技术创新效率。本文在梳理技术创新效率和种业技术创新相关理论的基础上,建立了种业企业技术创新效率评价的指标体系,并运用DEA-Malmquist指数模型对2013-2015年我国158家部级种业企业的技术创新效率进行了评价与分析,对繁育推一体化种业企业和非繁育推一体化种业企业的技术创新情况进行了对比。然后,在DEA测算出技术效率值的基础上利用Tobit模型从种业企业和政府两个方面探讨了种业企业技术创新效率的影响因素。最后,提出了相应的对策建议。本文的主要结论有:(1)2013-2015年,种业企业在整体上越来越重视技术创新,研发投入、产出不断增加,但企业自有品种销售额呈下降趋势。且不管是研发投入还是产出,不同种业企业之间均相差大,呈两极分化。(2)2013-2015年,种业企业技术创新的综合技术效率平均水平不断提升,但仍不到最高效率值的一半,可提升空间大,纯技术效率偏低是造成种业企业技术创新综合技术效率较低的主要原因,超过70%的种业企业技术创新的规模收益递减。(3)2013-2015年间,种业企业技术创新的全要素生产率整体下滑,技术进步不足是主要原因。(4)2013-2015年,不管在研发投入还是产出上,育繁推种业企业的平均水平均远高于非育繁推种业企业;繁育推种业企业技术创新的综合技术效率在整体上高于非繁育推种业企业,育繁推种业企业的纯技术效率远高于非育繁推种业企业,但非育繁推种业的规模水平优于育繁推种业企业。(5)企业规模和开展进出口贸易对种业企业的技术创新效率提升有显著促进作用;员工受教育程度正向影响种业企业的技术创新效率;科研经费投入强度、所有权性质和政府投入力度对种业企业技术创新效率的影响不显著。