伴随着国家对新能源的开发利用及光伏产业的大力发展，光伏发电将在整个电网中的比重越来越高，由于光伏发电技术与传统的发电技术相比，它受光照强度、温度等一系列不可预测的因素影响较大，输出的谐波将会对整个电网和用户带来极大危害。而国家对光伏系统的谐波并没有准确的标准要求，只是沿用常规电网谐波标准，对光伏谐波的研究就具有重要意义。本文针对光伏发电系统电能特征进行研究，尤其是光伏谐波的特殊性进行分析。通过对模拟滤波器法；瞬时无功功率理论法；小波变换法；基于神经网络法；傅里叶变换法的对比，本文选用了应用最广泛的傅里叶分析法，首先分析了傅里叶变换的理论及应用于信号分析的算法，对傅里叶分析方法应用于光伏谐波分析时所产生的频谱泄露和栅栏效应等问题进行介绍。针对这些问题，研究了常用窗函数频域特性及加窗插值算法对频谱泄露和栅栏效应的改进效果，在此基础上提出了基于卷积的Hanning卷积窗改进算法，并给出算法实现步骤。通过MATLAB仿真，对改进算法在微弱谐波幅值检测及简化计算量上的优越性进行验证，同时针对发电系统中常存在的间谐波进行了常用窗函数的对比仿真分析。针对光伏谐波分析上难以实现的同步采样，提出了软件的准同步采样方法，基于准同步采样可以减小频谱泄露和栅栏效应的产生，结合Hanning卷积窗改进算法，可以大大提高谐波参数分析精度。同时将准同步采样方法和Hanning卷积窗改进算法应用于光伏谐波检测系统中，并用准确的谐波信号验证系统对谐波的分析准确度。这就为光伏发电系统谐波治理提供实际的参考价值。也为谐波补偿装置的设计提供基本依据。