文昌鱼(Branchiostoma belcheri Gray)是国家二级保护水生野生动物,它是介于无脊椎动物和脊椎动物之间的过渡型动物,历来是现代生物学研究中的重要模型动物。青岛文昌鱼自然保护区于2004年建立,本文在春秋两个季节分别调查了文昌鱼保护区内的生物资源、文昌鱼资源以及环境因子,并将保护区内文昌鱼与其它产地文昌鱼进行了形态学比较,主要结果如下:1.保护区内春季出现50种渔业生物,其中鱼类23种,甲壳类16种,头足类5种;秋季出现44种渔业生物,其中鱼类29种,甲壳类10种,头足类4种。保护区内渔业生物优势种以小型低值鱼类、经济无脊椎动物为主,且优势种组成在不同季节存在较大变化。2.两个季节所获浮游植物由硅藻和甲藻两大类组成,共鉴定出浮游植物种类29种,其中硅藻24种、甲藻5种。春季优势种主要由加氏星杆藻、斯氏根管藻、中肋骨条藻、中华盒形藻、奇异菱形藻等组成,而秋季优势种主要是劳氏角毛藻、柔弱角毛藻、拟旋链角毛藻、复瓦根管藻、中肋骨条藻等。3.浮游动物以温带近岸低盐种为主,两个季节共出现大约23种,其中原生动物1种、毛颚类1种、桡足类14种、水螅水母类6种。其中春季优势种为太平洋真宽水蚤和海洋伪镖水蚤;秋季优势种为强壮箭虫和大眼剑水蚤。4.保护区内文昌鱼平均密度为44ind/m2,平均生物量为5.51g/m2,资源量约为340吨,在东经120°21′～120°23′,北纬39°59′～36°之间的狭长地带文昌鱼分布较集中。春季文昌鱼出现了30～35mm这一明显的体长组峰值,而秋季则出现了20～25mm、30～35mm两组比较明显的峰值。5.形态学特征的聚类分析与主成分分析结果显示保护区内文昌鱼与沙子口文昌鱼属于同一种群,青岛文昌鱼(保护区、沙子口)与秦皇岛文昌鱼、厦门文昌鱼差异显著。