血清应答因子(SRF)是MADS基因家族(MCM1、Agamous、Defficiens和SRF)的成员之一。它高度保守,表达广泛,是哺乳动物中的重要转录因子。在蛋白质互作网络中,SRF处于重要的位置,与许多蛋白因子相互作用。本实验以SRF为材料,对其与互作蛋白分子间、SRF的mRNA分子内进行了协同进化研究。主要内容如下:(1)通过对SRF的氨基酸序列和互作蛋白的氨基酸序列间互信息的计算,结合特定的标准化方法、阈值和互作蛋白间的互作区域,对蛋白间所有位点对进行检测,得到47个很有可能存在协同进化的位点对。通过不同角度的分析,其中17个位点对能够得到合理的生物学解释,提高了这些位点上存在协同进化关系的可能性。(2)通过对SRF的mRNA序列进行保守区段划分,结合最小自由能的方法计算出可能形成稳定二级结构的164个区段。在这些区段上,通过计算各个位点间的互信息值,结合特定的标准化方法、阈值和该区段序列的RNA二级结构,对该区段上所有位点对进行检测,得到12个很有可能存在协同进化的位点对。通过RNA二级结构的分析,从协同进化的角度合理地解释了这12个位点对上的进化关系。本实验通过生物信息学的方法预测出有可能存在协同进化的位点,为进一步的实验研究提供一定参考价值。