长链非编码RNA-IRAIN在喉癌组织基因印记的状态

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目的:人类胰岛素生长因子I(IGF1)是促肿瘤生长因子,在许多恶性肿瘤中表达上调,通过促进细胞增殖、抑制细胞凋亡以及与其它生长因子的信号传导通路相互作用实现促瘤作用,因而导致增长优势和肿瘤进展。IGF1印迹缺失或双等位基因表达被认为是早期肿瘤发生的显著特点。新的研究在IGF1R基因位点内发现了一种新的基因内长链非编码RNA(lncRNA),转录自内含子的启动子的反义方向,命名为“IGF1receptor antisense imprinted noncoding RNA--IRAIN”。该非编码RNA的表达完全来自父源等位基因,而母源等位基因表达抑制。为了探讨在喉癌细胞内,是否这个新发现的lncRNA也存在印记丢失的表达,本研究中我们通过检测与分析喉癌组织中的DNA及RNA,经PCR及基因测序证实转录新发现的lncRNA—IRAIN的等位基因在喉癌中的印记状态。以期有助于探索在基因水平诊治喉癌的新途径,为肿瘤的治疗找到新的治疗靶点和思路。方法:以吉林大学第二医院耳鼻咽喉头颈外科手术治疗的20名喉癌患者为研究对象,手术切下20例喉癌组织,这20例患者的手术标本均经病理科病理诊断证实为喉鳞状细胞癌,置于负80度冰柜冻存备用,通过提取组织标本的DNA和RNA,利用PCR扩增、产物纯化和直接测序等技术,将PCR产物送生物公司完成纯化和测序。结果:通过对20例喉癌组织DNA和RNA的提取和检测,cDNA测序分析结果显示,其中呈双等位基因表达的有12例,即该基因位点发生印记缺失,其余8例为单等位基因表达,即未发生印记缺失。基因组DNA扩增片段测序,检测到一杂合峰,示该位点杂合突变;cDNA扩增片段测序,相应位点显示杂合峰,示双等位基因表达,表明喉癌细胞内转录IRAIN的等位基因印记丢失。证明该对等位基因在喉癌组织中存在印记缺失的现象。结论:喉癌组织内转录IRAIN的等位基因有印记丢失的现象,对转录IRAIN的等位基因的印记状态的检测有望应用于肿瘤的早期诊断,另外,新发现的lncRNA——IRAIN也可应用于肿瘤的靶向治疗中,成为长链非编码RNA治疗肿瘤的一个新角色。
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