技术进步是经济增长的根本动力。在当今的市场经济环境中，企业的生存和竞争越来越依靠技术进步给企业提供连续不断的商务机会和市场需求，技术己普遍成为保持企业核心竞争力的关键资产。企业要在激烈竞争中维持长期竞争优势，唯一的办法就是要依靠不断地进行技术创新来建立自己的核心能力。 随着技术的复杂性和不确定性的不断增加，企业越来越难以独自承担高额的技术创新成本和风险；技术的交叉融合和外部效应也使企业单独从事技术创新的动力不足。在这种背景下，与以往重视通过企业内部的独立研究开发进行技术创新不同，目前产业界越来越注重与外界的科技资源形成有机的联系，不断加大与企业、大学和科研机构之间的技术交流和创新合作。尤其是在技术变化迅速、产业演变剧烈的部门，企业经常采用合作创新的灵活机制来快速响应外部环境的变化。由于我国的科技资源初始配置主要集中在大学和科研机构，企业的技术力量相对薄弱，内部研发能力不足，就更有必要利用外界科技资源进行合作创新。 如何进行合作创新才能取得良好的合作效果? 这是理论界和实业界共同关注的焦点问题之一。本文从非对称信息和人的机会主义行为假设出发，运用激励理论和机制设计方法，系统地研究了合作创新活动中合作当事人目标不一致且信息不对称情况下的逆向选择和道德风险问题，并提出相应的的契约和机制设计来加以防范，为我国的合作创新实践提供了有一定现实意义的理论参考。此外，本文还针对由于技术的外部效应所产生的技术市场失灵问题研究了政府在合作创新激励中的作用。全文内容分为三大部分： 1、合作创新的研究基础 这一部分首先介绍合作创新的相关概念、分类、模式和发展实践等基本内容；其次界定本文的研究范围为广义的合作创新，并根据创新成果的开发和完成状态分为事前合作(共同开发以形成创新成果)和事后合作(创新成果开发完毕后的许可转让)；最后，针对众多学者对技术创新战略的讨论，提出自己对这一问题的认识和观点。本部分内容后面的研究奠定基础。 2、合作创新的原因分析 这一部分研究合作创新的动机激励，主要解释为什么企业会选择合作形式进行技术创新。首先综述学者对合作创新动机的解释并对之进行归类；然后运用现有的实证研究结果检验各种合作动机的重要性差别，从中发现各种合作动机不但存在产业部门和技术领域的差别，还存在明显的国别差异；最后，针对交易成本理论、企业资源与能力理论和产业组织理论三种主要理论对合作创新行为的解释对这三种理论进行对比分析。通过对比本文更倾向于采用交易成本理论作为合作创新的主要理论基础。 3、合作创新的机制设计 这部分内容是本文的重点内容，共分三章。前两章研究合作创新行为激励，分析合作当事人之间的契约设计和风险防范；后一章讨论合作创新政府激励，研究政府如何采取措施激励合作创新行为。 在合作当事人目标不一致和非对称信息的假设下，本文以激励理论为理论基础对合作创新中的机会主义行为进行分析，分析采用了委托一代理框架、主要运用博弈分析方法和机制设计方法。在分析中，本文进一步对事前合作和事后合作两大类型按签约时序分别区分为签约前和签约后两种情况，两种类型的合作都会产生签约前的逆向选择问题和签约后的道德风险问题。这样两两组合共得到四种组合类别。本部分针对这四种组合类型讨论了相应的契约设计和防范机制。分析表明，带有提成费的契约设计既有信号显示的作用从而可以防范逆向选择行为，又有激励当事人努力的作用来遏制道德风险。除了契约设计以外，还讨论了防范逆向选择行为和道德风险危险的其他方式，如网络化交易、合作长期化、建立声誉、项目招标等。本部分除了模型推导外，还结合合作案例进一步补充说明不能很好融入模型中的其他控制措施。 本部分最后分析政府对合作创新的激励措施。主要针对由于技术的公共物品属性和技术产权界定的复杂性所引起的合作创新激励障碍讨论政府如何采取措施纠正技术市场供给失灵和弥补私人创新供给不足。本文分析了美国日本等国所采取的合作创新激励措施的异同和政策效果，以此作为对我国政府采取相应政策措施的借鉴。在具体的政策建议上，本文采用专家问卷调查方式确定政府鼓励合作创新政策的工作重点。本文认为，除了鼓励和支持合作项目以外，政府最重要的合作创新激励措施就是健全法规、进行产权激励以及提供公共技术服务。