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原发性肝癌(primary liver carcinoma,PLC)是世界上最为常见的恶性肿瘤之一,其中肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)占80%以上,每年发生在中国的肝癌新发病例和死亡病例占全球的50%以上,福建地区特别是闽南地区是我国肝癌高发地区之一,据报道,2014年福建省恶性肿瘤发病率为269.12/10万,肝癌位列第三;恶性肿瘤死亡率为164.40/10万,肝癌位列第一。近20年统计发现我国肝癌的发病年龄主要集中在40-60岁,40岁以下的患者所占比例在10%左右,但近年来40岁以下的肝癌发病率以每年1%-2%的速度增加,引起了社会重视。本文以闽南地区HCC患者为研究对象,基于全基因组甲基化测序技术,探讨青年HCC患者(≤40岁)与中老年HCC患者(>40岁)肿瘤发生发展的相关差异。研究内容:(1)回顾性分析闽南地区住院HCC患者的临床资料,将其分为青年HCC组与中老年HCC组,研究闽南地区青年HCC患者的流行病学特征。(2)利用全基因组DNA甲基化测序技术,构建青年HCC患者和中老年HCC患者全基因组范围内单碱基分辨率的DNA甲基化表达谱,为研究青年HCC与中老年HCC患者的发生发展差异机制提供理论基础,对差异甲基化基因进行GO及KEGG富集分析,并筛选关键基因。(3)利用在线数据库分析关键基因的表达情况。研究结果:(1)本研究结果发现青年HCC患者多发生在农村男性,确诊时多为肝癌晚期,手术治疗率低,肝功能分级多为B、C级;青年HCC患者的HBV感染率、ALT、AST及AFP阳性率显著高于中老年HCC患者(p<0.05)。(2)分析测序数据发现青年HCC组与中老年HCC组存在11993个DMRs,对应到4260个DMGs。差异显著的位点多分布在CHG和CHH序列环境。对DMGs进行GO功能注释和KEEG通路富集,发现显著富集到生物粘附、细胞发育等与肿瘤发生发展相关的生物过程;启动子区显著富集通路包括核糖体,吞噬等通路。分析显著富集通路涉及的基因,复现了许多已被报道与肿瘤相关的基因RPL11、MMP14等,并挖掘出青年HCC患者与中老年HCC患者发生发展相关差异的关键基因TAP2。(3)该基因启动子区在青年HCC组中甲基化水平显著低于中老年HCC组。通过UALCAN数据库分析,发现TAP2启动子区在HCC组织中甲基化水平显著低于正常肝组织,经GEPIA分析,发现其在HCC组织中显著高表达。结论:本研究首次对闽南地区青年HCC的流行病学特征进行探索。全基因组DNA甲基化测序揭示了青年HCC患者和中老年HCC患者的甲基化差异情况,并筛选出关键基因TAP2,其启动子区在青年HCC组中甲基化水平显著低于中老年HCC组,且其表达水平与启动子区甲基化水平呈负相关,TAP2的高表达或可作为青年HCC的检测指标。