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目的：采用薄层色谱法、紫外-可见分光光度法、高效液相色谱法对新疆紫草药材进行质量研究。使用高效液相色谱法建立指纹图谱,筛选出能够对不同来源的新疆紫草药材的品质优劣进行评价的有效方法。方法：考察了石油醚、乙酸乙酯、氯仿、二氯甲烷、正己烷、乙醇等有机溶剂对新疆紫草药材中的萘醌类成分的提取效果,采用L9(34)正交实验进行醇提工艺优选。收集新疆不同地区市场上销售的新疆紫草药材10批,采用薄层色谱法对10批新疆紫草药材进行鉴别,采用紫外-可见分光光度法(《中国药典》(2010版)法)测定羟基萘醌总色素含量,反相高效液相色谱法测定新疆紫草中左旋紫草素、乙酰紫草素、去氧紫草素、p,β’二甲基丙烯酰紫草素的含量。色谱条件为：色谱柱Scienhome Kromasil C18(4.6mm×200mm,5μm),流动相为乙腈-0.3%磷酸水溶液,采用梯度洗脱,流速1.0ml/min,柱温35℃,检验波长274nm,洗脱时间50min。使用国家药典委员会中药色谱指纹图谱相似度评价系统软件(2004A版)处理分析,建立新疆紫草药材HPLC指纹图谱。结果：1.最佳提取工艺为：药材粗粉,12倍量95%乙醇,冷浸8h。2.薄层色谱法鉴别,在紫外光灯(366n1n)检视,四种对照品左旋紫草素、去氧紫草素、乙酰紫草素、β,p’-二甲基丙烯酰紫草素都具有清晰的斑点,10批不同来源的新疆紫草供试品也具有相对应的斑点出现。3.紫外分光光度法测得10批药材中羟基萘醌总色素含量在0.6～17.3mg/g范围内。4.高效液相色谱测得左旋紫草素、乙酰紫草素、去氧紫草素、p,p’-二甲基丙烯酰紫草素分别在0.175-2.8μg/ml,25～400μg/ml,0.375～6mg/ml,25～400μg/ml范围内呈线性关系良好,r=0.9998、0.9999、0.9999、0.9999。左旋紫草素的含量范围为0.01-0.96mg/g,乙酰紫草素为0.39～24.1mg/g,去氧紫草素为0.77～31.1mg/g,β,p’-二甲基丙烯酰紫草素的含量范围为0.25-13.2mg/g。5.建立了紫草药材HPLC指纹图谱共有模式,标定了14个共有峰,鉴别出4个色谱峰的归属,经指纹图谱软件计算相似度,分析的10批紫草药材与对照药材之间相似度差异较大。结论：1.本实验建立的方法简单可行。2.通过薄层色谱鉴别,可知10批不同来源的紫草药材均为新疆紫草。3.通过测定紫草中萘醌类的含量,能够较为全面地反映紫草药材的内在质量。4.结合指纹图谱为紫草的质量控制研究提供科学依据。