【摘 要】
:
目的:探讨SAE1在三阴性乳腺癌(triple negative breast cancer,TNBC)中的表达情况及其对患者预后的影响。方法:通过癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库及GEO(Gene Expression Omnibus)数据库下载TNBC组织及正常组织信息共558例,再使用R语言软件(http://bioconductor.org/
论文部分内容阅读
目的:探讨SAE1在三阴性乳腺癌(triple negative breast cancer,TNBC)中的表达情况及其对患者预后的影响。方法:通过癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库及GEO(Gene Expression Omnibus)数据库下载TNBC组织及正常组织信息共558例,再使用R语言软件(http://bioconductor.org/bioc Lite.R版本3.5.0)对GEO数据集(GSE21653、GSE31448、GSE45827、GSE53752、GSE65216、GSE36295、GSE37751、GSE38959、GSW61724)及TCGA数据库的芯片数据进行质量分析,并将芯片数据进行整理转化和数据处理。收集2013年6月-2018年5月在福建医科大学附属协和医院手术切除且临床资料完整,诊断明确并存档的原发性TNBC病例207例。收集患者的临床资料,包括年龄、入院时间、手术类型、肿瘤大小、组织学分级、脉管瘤栓、淋巴结转移情况、复发或转移时间、死亡时间、死亡原因等。随访截止的时间为2020年12月31日。随访内容为患者肿瘤复发、肿瘤转移情况及患者的总生存期。应用免疫组织化学染色方法检测TNBC组织中SAE1的表达情况。通过卡方检验、单因素分析以及多因素分析(COX回归分析)明确SAE1、年龄、手术类型、肿瘤大小、组织学分级、脉管瘤栓、淋巴结转移等因素对TNBC患者预后的影响。结果:(1)使用R语言对GEO数据集(GSE21653、GSE31448、GSE45827、GSE53752、GSE65216、GSE36295、GSE37751、GSE38959、GSW61724)及TCGA数据库中共558例TNBC肿瘤组织和289例癌旁乳腺组织进行计算。结果显示相对于配对的非肿瘤乳腺组织,SAE1在TNBC组织中的m RNA水平显著增高。(2)TNBC组织样本207例,患者年龄27-72岁,中位年龄51岁,年龄≤50岁者93例,>50岁者114例;肿瘤直径≤2cm者86例,>2cm者121例;I级+II级者77例,III级者130例;有脉管瘤栓者134例,无脉管瘤栓者73例;无淋巴结转移者124例,有淋巴结转移者83例;接受全乳切除术者195例,接受保乳手术者12例。随访时间为7-78个月,中位随访时间为50个月。53例(25.6%)出现肿瘤复发或转移,154例(74.4%)未出现肿瘤复发或转移。34例(16.4%)死于乳腺癌。(3)SAE1表达于肿瘤细胞胞浆,切片总评分为肿瘤细胞染色强度0-3级乘以着色范围1-4分,分为低表达(0-6分)和高表达(7-12)。根据评分结果分为SAE1高表达组(SAE1-H)和SAE1低表达组(SAE1-L)。SAE1-H有78例,SAE1-L有129例。SAE1蛋白在TNBC肿瘤组织中的表达显著高于癌旁组织。在不同的年龄、肿瘤大小、组织学分级、脉管瘤栓、淋巴结转移情况、手术方式等分组中,SAE1的表达差异无明显统计学意义(P>0.05)。(4)单因素回归分析结果显示:年龄、肿瘤大小、组织学分级、脉管瘤栓、淋巴结转移情况、SAE1高表达与TNBC患者的无病生存期(Disease free survival,DFS)存在相关性(P<0.05);手术方式与无病生存期(DFS)无明显相关性(P>0.05)。组织学分级、淋巴结转移情况、SAE1高表达与总生存期(Overall survival,OS)存在相关性(P<0.05);年龄、肿瘤大小、脉管瘤栓及手术方式与总生存期(OS)无明显相关性(P>0.05)。(5)多因素分析结果显示:肿瘤大小、脉管瘤栓、淋巴结转移情况、SAE1高表达是TNBC患者无病生存期(DFS)的独立影响因素(P均<0.05);组织学分级、淋巴结转移情况、SAE1高表达是TNBC患者总生存期(OS)的独立影响因素(P<0.05)。结论:(1)TCGA数据库及GEO数据集(GSE21653、GSE31448、GSE45827、GSE53752、GSE65216、GSE36295、GSE37751、GSE38959、GSW61724)中SAE1在TNBC组织中的m RNA水平较正常乳腺组织显著增高。(2)SAE1蛋白在TNBC肿瘤组织中的表达显著高于癌旁组织。(3)在不同的年龄、肿瘤大小、组织学分级、脉管瘤栓、淋巴结转移情况、手术方式等分组中,SAE1的表达差异无明显统计学意义(P>0.05)。(4)SAE1高表达是TNBC患者肿瘤复发或转移及总生存的危险因素。SAE1可以作为TNBC预后评价的一个指标。
其他文献
目的:研究经直肠动态三维超声造影断层成像(dynamic three-dimensional contrast-enhanced transrectal tomographic ultrasound imaging,Dynamic3D-CETRUS TUI)诊断前列腺良恶性病变的准确性,同时探讨基于3D-CETRUS TUI与经直肠超声(transrectal ultrasound,TRUS)认知
目的进行中晚期肺腺癌获得性T790M突变与一般临床特征的相关性分析。探索易发生获得性T790M突变的肺腺癌患者的基本规律及特点,为临床治疗提供指导。方法搜集并回顾性分析了我院从2010年1月至2020年09月接受EGFR-TKIs治疗的119例中晚期肺腺癌患者的一般临床资料,采用SPSS22.0软件卡方检验对患者的一般情况(性别、年龄、吸烟史、突变类型及服用靶向药物)、初始血清学状态(肿瘤标记物C
目的:探索通过化学合成方式构建具有磁共振成像和胰腺癌基因沉默作用的多功能影像分子探针的合成条件,并在体内外评价该分子探针的生物特性、显影条件和治疗效果。方法:1.PEI/SPION基因载体的构建。通过有机高温热分解法制备尺寸均一可控的有机相SPION晶体,通过动态光散射法(DLS)检测了其粒径大小和分布,通过透射电子显微镜观察纳米晶体的分布与晶面间距。用N,N’-羰基二咪唑(CDI)对胆固醇(Ch
目的:探讨预防性卵巢切除术在原发性T4期结直肠癌治疗中的价值。资料与方法:采用回顾性队列研究方法,分析福建医科大学附属协和医院于2011年11月至2018年09月期间收治并行手术治疗的原发性T4期结直肠癌女性患者的临床病例资料。纳入标准:术后病理分期(p TNM)分期为p T4期的原发性结直肠癌患者;且病理证实为R0切除。排除复发性结直肠癌患者。按是否行预防性卵巢切除术分为预防性卵巢切除组(94例
背景及目的:胃癌是一种恶性肿瘤,术后的5年生存率为20-35%。目前,基于5-氟尿嘧啶(5-fluorouracil,5-FU)的辅助放化疗是胃癌患者术后的首选治疗方案。由于肿瘤的异质性,不同患者接受该治疗方案后的生存结局差异较大。因此,亟需识别一个标志来预测胃癌患者术后接受5-FU辅助放化疗后的生存,为胃癌患者的临床治疗提供重要参考。方法:本研究共收集了来自芯片和二代测序平台检测的1252例胃癌
目的运用meta分析的方法评价幽门螺旋杆菌感染(H pylori)与原发性肝癌(HCC)的关系,进一步明确H pylori是否为肝癌的影响因素,为临床上肝癌的预防和治疗提供参考。方法通过计算机检索2000年1月至今发表在中国知网、万方、维普、Pubmed、Cochrane.Library等数据库中的国内外文献,收集关于H pylori和原发性肝癌关系的病例对照研究。受试患者年龄和性别、种族不限,实
胶质瘤是恶性脑瘤中最具侵袭性的一种,具有高度异质性以及很强的迁移侵袭能力,无法被目前传统的手术治疗以及放化疗所根治,胶质瘤的高复发性严重降低患者的生存率,因此胶质瘤药物研发的一个重要目标是抑制胶质瘤的迁移与侵袭。迄今大部分药物对胶质瘤细胞迁移侵袭的离体实验都是在高糖培养基中进行的,这些培养基含有25 m M的葡萄糖,接近于在体血糖浓度的5倍,而血糖浓度的葡糖糖在细胞培养中则常被称为低糖(标记为LG
目的目前关于KLF6去泛素化过程的研究较少,本课题旨在筛选出KLF6的去泛素化酶,探索去泛素化酶USP26调控KLF6的分子机制以及对宫颈癌细胞生物学功能的影响。方法1、在Hela、MCF-7、Huh7等细胞系中加入MG132处理6h,Western blot检测KLF6蛋白水平的变化,挑选出KLF6蛋白水平升高的细胞系作为目的细胞系。2、将已构建的约96个去泛素化酶质粒转染进293T、Hela细
【研究目的】检测肝细胞癌(Hepatocellular carcinoma,HCC)癌组织中B7-H3分子的表达水平,分析其表达量的临床意义;然后通过体内外实验探究抑制B7-H3分子对T淋巴细胞免疫活性的影响以及对HCC的免疫治疗作用,初步探讨对HCC免疫微环境的影响。【研究方法】1.收集61例经手术切除并经病理医师诊断的HCC癌组织样本,通过随访调查,收集整理这61例HCC患者的临床病理资料。2
肝细胞癌(Hepatocellular carcinoma,HCC,简称肝癌)是目前全世界的恶性肿瘤中最常见的一种,具有早期诊断困难、容易复发、预后差等特点。深入研究肝癌的发生、发展、转移和复发的相关影响因子和作用机理,探索肝癌早期诊断、分子靶向治疗的靶点和预测转移、复发相关的生物标志物因具有临床意义,成为近年来肝癌研究的主要方向之一。近年来,由于高通量测序技术和生物信息学的不断进步与完善,人们对