【摘 要】
:
探索蛋白质序列内部的重复片段近来已成为分析蛋白质序列中的一个研究热点,因为序列中的重复片段对于研究蛋白质的结构与功能以及蛋白质的进化路径有着至关重要的作用。许多
论文部分内容阅读
探索蛋白质序列内部的重复片段近来已成为分析蛋白质序列中的一个研究热点,因为序列中的重复片段对于研究蛋白质的结构与功能以及蛋白质的进化路径有着至关重要的作用。许多的大蛋白就是经过基因序列的内部复制和融合进化而来,这些重复的片断对应着一些相似的结构和功能单元。胰凝乳蛋白酶(chymotrypsin)就是一个典型蛋白质基因复制的例子。但是由于蛋白质在进化过程中常常会发生一些插入、删除以及突变等过程,导致了序列的重复单元并不是完全一致,会出现一些分歧,甚至有时候两个重复的结构域被一些大的环区隔离开,这给寻找蛋白质序列的周期性以及重复边界增加了很大的困难。本文以Single-stranded Left-handed Beta-helix Fold (LβH)为研究对象,分析这类蛋白质内部与结构重复相对应的重复序列。有关结构研究指出,LβH折叠子具有整体结构的两重对称性。然而序列它们的一级序列却没有呈现出相应的两重对称性,这似乎有悖于Anfinsen提出的序列决定结构的假设。为此,我们利用改进的重现图方法,并且结合氨基酸的物理化学特性以及统计显著性分析,将隐含在序列中的两重对称性很好的展示出来。我们的研究表明:(1)该类蛋白质氨基酸序列中确实隐含了与结构相对应的两重对称的信息。这意味着蛋白质的对称结构可能是来自于对称的氨基酸序列,序列的特征决定了结构的特征。(2)鉴于这类蛋白质所有的氨基酸序列都具有序列的两重对称性,且与结构的对称性相一致,我们大胆的假设,这一类蛋白质可能存在一种共同的进化模式,即:首先半螺线管的祖先结构通过基因的自身复制,产生两段相同的半螺线管结构,然后这两段相同的半螺线管经过基因融合,并在融合的过程中发生突变,最后结合成整个螺线管结构。因此使这种螺线管结构具有序列上和结构上的两重准对称性。
其他文献
目的对4种级别的临床护士进行影响护患关系相关因素的认知现状调查,为护理管理者对不同级别护士开展岗位培训课程设置提供依据。方法采用自行设计的护士对影响护患关系的相关
庙宫水库除险加固排沙洞工程在竖井混凝土浇筑过程中,对自平衡导管在高落差混凝土的垂直运输进行了研究和应用,试验结果是成功的,对类似工程有借鉴作用。
城市的快速发展带来的用地不足和交通拥堵等问题,催生了轨道交通综合体的产生。这种多功能性和复杂性的复合建筑形式,对城市空间、文化、环境等方面有着积极影响,其公共空间
目的 :确定匹罗卡品点燃鼠持续性癫痫后的急性和慢性行为改变及组织学影响。方法 :癫痫持续状态后 ,对存活鼠以影像监控系统连续监测 12 0 d,2 4h/ d。以光镜观察其脑部损伤
婴幼儿期是体格生长、智能发育和行为形成的关键时期。由于婴幼儿生长发育和行为能力的特点,在喂养过程中处于相对被动的地位,因此喂养者的喂养方式、喂养条件、喂养类型等喂
通过对晋城及周边地区信息技术类行业及企业的调研,总结并分析了本地区计算机应用技术专业人才的需求状况、毕业生就业面向和职业岗位能力;同时就专业改革从校企合作、专业方
在中国明代书法史上,祝允明和文徵明、王宠、陈淳并称为“吴中四名家”。祝氏狂草法书《唐宋词卷》原为已故北京大学校长周培源旧藏,20世纪80年代归无锡博物院。该手卷内容为
SOA体系结构开发设计中,开发方法选择确定是重点研究的方向,对于软件开发阶段所存在的各类问题,通过开发技术优化设计,均能够得到有效的解决。本文重点研究软件开发中的功能
随着我国国力的不断提升,建筑物高度不断向着更高的领域发展,水平荷载作用下结构的侧向位移也就变得越来越重要。在高层结构设计中,结构工程师的主要任务之一就是找到最佳方案,以控制结构在风荷载或者地震荷载下的侧向变形。当结构侧移过大时,通常采用的方法是加大抗侧力结构如剪力墙、筒体等的刚度来控制变形。但这种方法,不但使得建筑物的造价增加,也由于竖向构件截面过大而对建筑的使用功能造成不良影响,而且超高层建筑常
利用X线荧光光谱(XRF)、X线光电子能谱(XPS)和红外光谱(IR)技术,分析了4种柴油发动机排气管内积存的碳颗粒物的微观组成、存在形态和颗粒物的表面物种组成,并讨论了它们与灰霾污染