黄瓜花叶病毒卫星RNA(Cucumber mosaic virus satellite RNA CMV-satRNA)是一类大小在307-405nt之间,线型、单链,非编码的RNA分子。目前已经报道了100多条CMV-satRNA的序列,分别寄生在65种以上的亚组I和II的CMV上。CMV-satRNA完全依赖于辅助病毒(helper virus)进行复制,包被并传播。CMV-satRNA大多集中在332-342nt,有一些特大satRNA,大约为386-405nt[1]。在CMV-sat RNA的5’端近80个碱基和3’端近45个碱基相当保守。与小片段的CMV-satRNA相比,大片段的卫星序列增加了一些中间插入片段[39]。CMV-satRNA对辅助病毒在寄主植物上的症状为减轻、加重或无影响,对辅助病毒症状的影响与卫星RNA、辅助病毒和寄主植物三者都相关。本论文旨在研究sat405的活性,及其以CMV-Fny为辅助病毒在寄主植物上的症状。sat405序列由NCBI数据库下载得到,并人工合成在PUC51质粒上。sat405的cDNA经体外转录与CMV-Fny的基因组RNA按一定比例混合接种于心叶烟,观察并检测其存活特性及其对CMV-Fny致病症状的调节。本文进一步分析了sat405的序列及其二级结构。对CMV-Fny携带卫星前后在本生烟上引起的光合作用的差异进行了研究。分别观察了CMV-Fny携带卫星前后在心叶烟(Nicotiana glutinosa),本生烟(Nicotiana benthamiana),番茄合作903(Solanum lycopersicum hezuo 903),普通烟(Nicotiana)等植物上的症状,研究卫星、病毒、与植株之间的互作情况。主要研究结果:sat405以CMV-Fny为辅助病毒在寄主植物上经过反复转接传代后仍保持序列的稳定性。sat405的cDNA的体外转录产物与被CMV-Fny+sat405侵染的寄主植物叶子的汁液一样都具有侵染活性。经过双链RNA的分析检测发现sat405以CMV-Fny为辅助病毒在寄主植物上高含量积累。荧光定量PCR显示了sat405与CMV-Fny在番茄合作903上假重组后,sat405对CMV-Fny病毒基因组表达量起到上调作用。本生烟被病毒侵染前后的光合作用检测结果为:被四种毒源侵染后的本生烟相对于健康植物光合作用减小。CMV-Fny侵染后减小本生烟的光合作用,携带satT1和sat405后的CMV-Fny侵染本生烟后进一步减小光合作用,减小的程度大于CMV-Fny ,而CMV-Fny+satYN12相对于CMV-Fny增大本生烟的光合作用。序列分析结果显示sat405相对于satT1和satYN12在186位至213位插入一段序列。利用DNA Star软件,将sa405与satT1和satYN12的序列比对,结果显示:satT1相对于sat405和satYN12在81位至107位缺失一段序列,在114,115位和155—157位缺失碱基。satYN12相对于sat405的序列在186位至213位缺失一段序列,satT1相对于sat405的序列在181位至213位缺失一段序列。satYN12相对于sat405的序列在177位至182位缺失6个碱基。三个卫星在3’端和5’端基本保守。研究表明其致病区域的定位不能单纯以sat405与其他CMV-satRNA的序列比对而得出。而应该利用sat405序列的突变(替换、插入或缺失)具体定位致病碱基,并研究具体的突变对其二级结构的影响。