基于陆生适应条件下的水、陆稻千粒重遗传变异分析和关键基因发掘

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陆稻(Upland rice),通常指能在坡地、无垠旱地及干旱环境正常生长的栽培稻类型。在自然选择和人工选择的双重压力下,陆稻由普通野生稻(Oryza rufipogon Griff.)经过长期进化而形成不同于水稻的生态型。陆稻陆生适应性和产量形成具有极大的相关性,而粒重是产量构成的重要因素之一,是稻谷中重要的驯化性状。本研究通过对167份水稻和陆稻的产量相关性状开展表型数据收集、整理及分析、总结。并对试验材料的千粒重性状进行全基因组关联分析,挖掘与陆稻陆生适应性相关的千粒重位点及候选基因。主要结果如下:1、有效穗和穗粒数是导致水、陆稻单株产量存在极显著差异的主要因素。在旱地环境下,陆稻千粒重极显著高于水稻千粒重,致使陆稻单株产量显著高于水稻单株产量。可见,在陆生环境下,千粒重是水、陆稻产量产生差异的重要因素。2、适应旱地环境的OsNced2T/OsTb2C型陆稻千粒重极显著高于OsNced2C水/陆稻和OsTb2T水/陆稻。推测在自然选择和人工选择的双重压力下,陆稻通过增加粒重的形式来增加产量,进而表现出对陆生环境的适应。3、利用全基因组关联分析定位到一个与千粒重显著相关的稳定位点,位于5号染色13.92-14.22 Mb区间。然后对候选区间内基因进行注释、表达量预测和单倍型分析,最终将Os05g0307200、Os05g0307400定为本研究的关键候选基因。综上,在陆生环境下,千粒重是调节陆稻产量的重要因素,也是陆稻通过增加千粒重来增加产量,进而表现出对陆生环境的适应性。本研究通过全基因组关联分析筛选到了一个与水、陆稻千粒重遗传变异显著相关的稳定位点qUAR1以及影响粒重的关键候选基因Os05g0307200和Os05g0307400,为后续的陆生适应性研究提供理论参考。
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