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本研究以广元市唐家河国家级自然保护区和南充市金城山森林公园的柔毛淫羊藿（Epimedium pubescens）为研究对象,采用高效液相色谱法（HPLC）和紫外分光光度法测定柔毛淫羊藿中有效药用成分（淫羊藿苷和总黄酮）的含量;同时利用Miseq高通量测序技术研究了柔毛淫羊藿根际土壤微生物多样性,以期为柔毛淫羊藿的栽培提供理论依据,主要研究结果如下:1.不同群落样地有效药用成分研究。（1）唐家河三个群落中（A,B和C）,群落A中柔毛淫羊藿的淫羊藿苷含量最高,群落B中的淫羊藿苷含量最少;群落A中黄酮含量最少,群落C中的黄酮含量最多。（2）金城山森林公园群落中,淫羊藿苷的含量依次为公路﹥栈道﹥树林﹥竹林;黄酮含量依次为竹林>公路﹥栈道﹥树林;（3）在公路群落不同季节中,淫羊藿苷含量依次为冬天﹥秋天﹥春天﹥夏天,黄酮含量依次为冬天﹥夏天﹥秋天﹥春天,冬天柔毛淫羊藿中淫羊藿苷和黄酮含量都是最高的。2.不同群落样地微生物多样性的研究。（1）唐家河保护区A、B、C三个不同群落中:多样性指数（shonnon）依次为群落B﹥群落A﹥群落C,但丰富度（chao）依次为群落C﹥群落A﹥群落B。因此群落B的多样性最高,但丰富度最低,而群落C的多样性最低,丰度最高。进一步对土壤微生物的物种组成进行分析,三个不同群落中共有的几大优势中为变形菌门（Proteobacteria）、酸杆菌门（Acidobacteria）、绿弯菌门（Chloroflexi）、放线菌门（Actinobacteria）、硝化螺旋菌门（Nitrospirae）、拟杆菌门（Bacteroidetes）、芽单孢菌门（Gemmatimonadetes）、浮霉菌门（Planctomycetes）和Latescibacteria。其中,变形菌门、酸杆菌门、绿弯菌门为最优势菌群。群落A的绿弯菌门含量比群落B群落C多,群落B和群落C中硝化螺旋菌门、拟杆菌门优于群落A。（2）金城山森林公园群落中,多样性指数（Shannon）依次为栈道旁﹥公路旁﹥竹林处﹥树林处,但丰富度（chao）依次为公路旁﹥栈道旁﹥竹林处﹥树林处,栈道处群落的多样性性最高,但公路处丰富度最高,树林处群落的多样性和丰富度都最较低;进一步对土壤微生物的物种组成进行分析,四个不同群落中变形菌门、酸杆菌门、绿弯菌门、放线菌门、硝化螺旋菌门、浮霉菌门、芽单孢菌门是主要的菌群。其中变形菌门、酸杆菌门、绿弯菌门为优势菌群。但群落公路处和栈道处的绿弯菌门含量高于树林处群落和竹林处群落,树林处群落和竹林处群落中变形菌门含量优于群落公路旁和栈道旁。（3）不同季节中,多样性指数依次秋天﹥冬天﹥夏天﹥春天;丰富度依次为秋天﹥冬天﹥夏天﹥春天。说明四个季度中多样性和丰富度变化一致,秋天多样性和丰富度都高的,春天的多样性和丰富度最低。进一步对土壤微生物的物种组成进行分析,四个季度共有的几大优势菌种是变形菌门、酸杆菌门、绿弯菌门、放线菌门、硝化螺旋菌门。变形菌门在春季所占比例少于其他三个季节;酸杆菌门在秋天含量最高;绿弯菌门在冬季含量少于其他三个季节;放线菌门在四个季度差异不大,硝化螺旋菌门在春夏中的占比显著多于秋冬。3.土壤微生物与有效药用成分的相关性分析。（1）唐家河保护区土壤中Acidibacter与淫羊藿苷的含量呈显著正相关,其它相关性都不显著;Nocardioioides,Haliangium和Nitrospira与淫羊藿苷的含量呈显著负相关,其它相关性都不显著。总黄酮含量与土壤微生物没有显著相关性。（2）金城山中BurkholderiaspyxAZ32与淫羊藿苷的含量呈显著负相关。总黄酮含量与土壤微生物没有显著相关性。（3）不同季节中,H16和淫羊藿苷的含量呈显著负相关。Hliangium与总黄酮含量呈显著负相关。