鸡白痢沙门氏菌是现代养禽业中最普遍的细菌性疾病之一。目前，控制鸡白痢感染的手段主要有接种疫苗，药物控制和消除净化，但这些方法都有短板。随着抗病育种工作的开展，通过与分子标记联合选育品种的手段，从遗传水平上筛选先天抗病能力强的群体是对抗病原菌感染最深入有效的方法之一。机体感染鸡白痢沙门氏菌会触发先天性免疫通路。其中MyD88作为TLR家族信号转导通路上最重要的一个衔接蛋白，在抗菌感染相关的研究中受到广泛关注。有研究表明，鸡群在感染鸡白痢沙门氏菌后，MyD88基因表达水平上调，但其mRNA转录后调控的机制并未见报道。3-UTR中的AREs是调控基因转录后表达的功能性元件。AREs通过调节mRNA稳定性和翻译效率来调控蛋白的生物学活性是近年的研究热点。而MyD88基因的3-UTR与机体是否易感鸡白痢沙门氏菌的关系尚未见报道。　　为了探索MyD88基因的3-UTR中单核苷酸多态性是否与抗鸡白痢沙门氏菌感染相关，我们对优质SD鸡连续两个世代，SD04世代和SD05世代进行了遗传关联研究。两个世代共4，400只300日龄种母鸡经全血平板凝集检验鸡白痢沙门氏菌后，将阳性个体集成2个病例组，分别包含SD04世代81例，SD05世代61例;阴性个体集成2个对照组，分别包含SD04世代90例，SD05世代66例。所有样本血样静脉翅下采取，然后采用苯-氯仿萃取法提取全基因DNA，扩增样本MyD88基因的3-UTR区域片段，测序后筛选单核苷酸多态性位点。通过R软件对同世代SNP进行卡方检验，对比两个世代间位点、等位基因频率和基因型频率在病例-对照组中分布的差异性。同时，对SNP位点构建的单倍型进行关联鸡白痢抗病性分析。结果发现:　　1.两个世代共筛选出13个SNP，其中10个SNP符合哈迪-温伯格平衡。SD04世代中SNP4(g.4810293 C＞A)等位基因频率和基因型频率在病例-对照组之间分布都存在显著差异(p＜0.05)。并且，SNP4的OR值等于0.6088，95％CI为0.531-0.9759，说明该位点对感染鸡白痢沙门氏菌有抵抗作用。SD05世代中只有SNP13等位基因在病例对照组之间分布存在显著差异(p＜0.05)，并且SNP13的OR值为1.8012，95％CI为1.0247-1.4827，说明SNP13对鸡白痢沙门氏菌易感。　　2.SD04世代中SNP1、SNP2(g.4810266A＞G，g.4810372 C＞T)组成的单倍型GG，AA，以及SD05世代中SNP1、SNP2和 SNP11组成的单倍型GTG、ACA、GCG、ACG和GCA，在病例对照中分布不存在显著差异(p＞0.05)。但SD04世代中位点 g.4810266 A＞G与g.4810372 C＞T;位点SNP5(g.4810191 A＞G)和SNP6(g.4810253A＞G)与位点SNP7(g.4810276 C＞T)，g.4810293 C＞A，SNP8(g.4810352 C＞T)均存在强连锁不平衡，与SD05世代不同，连锁不平衡被削弱，说明SD04世代阳性个体的淘汰改变了SD05世代鸡白痢沙门氏菌位点的易感或抗病性。　　以上结果表明，不同世代，不同位点的多态性所表现的抗病性或易感不同。但总体来说，MyD88基因的3-UTR中单核苷酸多态性位点与鸡白痢沙门氏菌感染有一定关联性，在进行分子辅助标记选种时，本试验数据中位点可提供参考。