近年来，中国农业经济在快速发展的同时也面临着巨大的资源环境压力，农业污染和能源消耗等环境问题日益突出，农业的资源基础日益脆弱，在很大程度上农业的高增长是以高碳排、高污染和高能耗为代价。中共十八届五中全会提出了“创新、协调、绿色、开放、共享”五大发展理念，单纯依靠增加要素投入的粗放型农业，已经不符合现代农业的发展要求。绿色农业是实现农业可持续发展的必然选择，而农业创新是发展现代农业的根本动力。构建中国农业绿色创新系统，把“绿色”和“创新”放在同等重要的位置上来发展现代农业已刻不容缓。那么我们首先面临的问题就是，什么是农业绿色创新系统？中国的农业绿色创新系统绩效水平如何？区域农业“绿色”和“创新”发展是否协调？各省份农业绿色创新绩效的差异性和变化趋势如何？是否具有空间收敛性？然而，在研究农业问题的过程中同时考虑“绿色”和“创新”的研究并不多见，对农业绿色创新系统的理论和定量分析更是研究的薄弱点。　　基于此，本文以农业绿色创新系统为研究对象，并将农业绿色创新系统定义为：以绿色农业理念为驱动，以农业的绿色技术创新为基础，以农业环境、经济和社会的协调发展为目标，以有助于节约资源、减少污染的创造性活动为主的农业经济促进系统，首先从绿色农业、创新农业和农业绿色创新系统三个方面梳理国内外相关文献，并进行分析评述。其次，从农业绿色创新系统的概念界定和相关理论着手，将农业绿色创新系统划分为三个子系统：农业经济社会子系统、农业科技创新子系统和农业绿色生态子系统，构建测算其效率的指标体系。然后，基于农业碳排放、绿色 GDP的核算结果和2002-2013年间的面板数据，运用三阶段DEA模型，对中国31个省区的农业绿色创新系统及三个子系统进行绩效评价，分析其空间差异特征和时间变化规律。论文研究内容主要为：文献综述与理论基础（第一、二章）、指标体系构建、数据来源和处理（第三章）、子系统绩效水平及农业发展模式分析（第四章）、农业绿色创新系统的效率测度及时空演变（第五章）、结论与未来展望（第六章）。　　论文得出以下主要结论：第一，中国农村经济社会子系统、农业科技创新子系统和农业绿色生态子系统的技术效率总体均表现出上升趋势；第二，中国不同区域农业绿色创新系统的效率总体上水平差距较大，西部效率最高，东部和中部次之，东北地区最低；第三，在农业绿色创新系统中，基础设施的优化、自然灾害频发和经济发展水平增加，有利于政府资金的投入和合理配置，有利于农业绿色创新系统效率的提升；第四，中国农业绿色创新系统的技术效率2002-2013年总体上没有呈现出十分明显的?收敛和发散趋势，全国、东部和西部地区农业绿色创新系统的技术效率分别以3.4％、6.2%和13.8%的速度趋于绝对β收敛，中部和东北未呈现出绝对β收敛趋势，东部和西部省区间差距逐渐缩小，落后地区对发达地区的追赶现象明显。