【摘 要】
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华贵栉孔扇贝（Chlamys nobilis）是我国重要的海水养殖贝类。自2008年以来,本实验室着手华贵栉孔扇贝遗传育种工作,于2015年培育出国家级水产新品种华贵栉孔扇贝“南澳金贝”（此后简称“南澳金贝”）,产生了巨大的经济效益。由于人工育苗过程中对大个体的刻意选择和采用雌多雄少的交配策略,经过多年的人工养殖,“南澳金贝”可能出现了一定程度的近交。如对“南澳金贝”的生长性状进行选育能达到何种效
【基金项目】
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国家重点研发计划“蓝色粮仓科技创新”重点专项（2018YFD0901400）子课题； 国家自然科学基金项目（31872563,42106126）； 国家现代农业产业技术体系建设项目（-CARS-49）； 广东省重点领域研发计划项目（2021B0202020003）；
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华贵栉孔扇贝（Chlamys nobilis）是我国重要的海水养殖贝类。自2008年以来,本实验室着手华贵栉孔扇贝遗传育种工作,于2015年培育出国家级水产新品种华贵栉孔扇贝“南澳金贝”（此后简称“南澳金贝”）,产生了巨大的经济效益。由于人工育苗过程中对大个体的刻意选择和采用雌多雄少的交配策略,经过多年的人工养殖,“南澳金贝”可能出现了一定程度的近交。如对“南澳金贝”的生长性状进行选育能达到何种效果?“南澳金贝”还保持着何种程度的遗传多样性?要回这些问题亟需要对其种质资源进行评估才有可参考的理论依据。本研究以华贵栉孔扇贝“南澳金贝”群体为材料,采用群体截头方法选育构建了2个歧化生长性状选育群体（上选组和下选组）和1个对照群体,评估了它们的遗传参数,采用SSR和InDel两种分子标记评估了三个群体的遗传多样性参数,采用转录组学筛选了三个群体的差异表达基因,主要结果如下:1.自40天稚贝起,上选组的壳长和遗传参数与对照组的没有显著差异,而下选组的都始终显著地小于其他两组;下选组的壳长始终显著小于上选组,但其遗传参数却始终显著大于上选组。上选组群体的平均选择反应、现实遗传力、遗传获得分别为0.183±0.143、0.115±0.009和3.271±2.656;下选组的平均选择反应、现实遗传力、遗传获得分别为0.595±0.187、0.298±0.094、7.289±3.183。2.SSR标记的遗传多样性分析:在上选、下选组和对照组群体中,共分别检测到36个、47个和43个等位基因,PIC平均值分别为0.327±0.078、0.331±0.079和0.379±0.091;I平均值分别为0.695±0.215、0.865±0.233和0.858±0.217,三个群体均显著偏离哈迪-温伯格平衡。3.InDel标记的遗传多样性分析:所有位点的Ne平均值为1.519±0.297。PIC变化范围为0.141～0.506,平均值为0.274±0.099。I范围在0.2146～0.963之间,平均值为0.525±0.187。其中有5个位点显著的偏离遗传平衡状态,有4个位点的遗传偏离指数（D）为负值。4.三个群体间的差异基因数目较少,上选组与下选组的差异表达基因总数为462个,上选组与对照组的差异表达基因总数为603个。两个差异分析组的交集有140个表达量相似的差异表达基因。其中87个为上调基因,53个为下调基因。共筛选到6个上调基因与生长发育相关基因。其中3个与肌动球蛋白的组成调控有关;1个参与胰岛素的生成调控;1个参与蛋白水解过程;1个与贝壳钙化有关。通过对“南澳金贝”养殖群体进行选育并评估其遗传参数,以及不同分子标记的群体遗传多样性检测,从多个角度揭示了“南澳金贝”养殖群体的种质状况,为其种质资源的保护、开发利用以及遗传育种工作提供理论依据和数据参考。
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