人GIDRP88选择性剪接体的鉴定和功能研究

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生长抑制和分化相关蛋白88(growth inhibition and differentiation related protein 88,GIDRP88)基因是在研究抗癌药物作用机理时,通过抑制消减杂交等技术获得的,初步认为该基因与肿瘤分化、生长和细胞周期相关。实验提示该基因存在不同的表达形式,可能是选择性剪接体,但是还需要进一步证实。 本学位论文报道了一个与细胞生长和分化相关的新基因GIDRP88A的克隆和研究结果,GIDRP88A是未知功能基因GIDRP88的选择性剪接形式。采用RT-PCR技术扩增GIDRP88,然后采用3’-RACE和5’-RACE方法,从乳腺癌细胞MDA-MB-231扩增到一个GIDRP88的新剪接型全长cDNA,其全长为2416bp,命名为GIDRP88A。生物信息学分析表明,GIDRP88A基因的选择性剪接位点都位于阅读框内,其全长cDNA比GIDRP88短约1kb,其中6号外显子缺失和5号外显子部分缺失,并在5号外显子缺失部位多出一个碱基A,导致终止密码子提前出现;GIDRP88A基因所编码的蛋白质与GIDRP88相比在C-端少了566个氨基酸残基,而GIDRP88基因所编码的蛋白质在C-端有两个与功能相关的重复区,因此,可能导致GIDRP88A基因的功能部分丧失,但是,仍然保留了与细胞生长和分化相关的结构域。此外,通过半定量RT-PCR技术,分析了GIDRP88A以及GIDRP88在正常和肿瘤组织中的表达水平,发现GIDRP88A在正常组织中高表达,在肿瘤组织中则呈低水平表达;而GIDRP88在正常和肿瘤组织中均呈高表达,提示二者之间在功能作用
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